76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0726 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  822    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  52.22 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  51.6 
 
 		 392 aa  348  8e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  46.06 
 
 		 376 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  41.27 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3589  hypothetical protein  46.58 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  36.34 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  28.72 
 
 		 411 aa  199  7e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  28.16 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  28.16 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3246  hypothetical protein  31.83 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  40.64 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  33.71 
 
 		 411 aa  176  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  32.99 
 
 		 413 aa  174  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  29.76 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3162  SAM dependent methyltransferase  33.58 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1046  hypothetical protein  30.65 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  33.83 
 
 		 389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4406  hypothetical protein  30.47 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4318  hypothetical protein  30.03 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  27.66 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  28.93 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  31.13 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  27.62 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  26.56 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0414  SAM-dependent methyltransferase  33.61 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.675076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  27.58 
 
 		 399 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  27.54 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  27.54 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  29.41 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  27.3 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46056  predicted protein  33.68 
 
 		 612 aa  147  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  26.92 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0682  hypothetical protein  30.8 
 
 		 294 aa  107  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.189745  normal  0.58708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  31.11 
 
 		 283 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  31.11 
 
 		 280 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  30.74 
 
 		 283 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  31.25 
 
 		 277 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  27.27 
 
 		 276 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1006  hypothetical protein  30.08 
 
 		 320 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1150  hypothetical protein  28.68 
 
 		 294 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3605  hypothetical protein  27.07 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3617  hypothetical protein  27.07 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4678  hypothetical protein  26.22 
 
 		 278 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3601  hypothetical protein  26.22 
 
 		 278 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  27.17 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  27.47 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0428  hypothetical protein  28.28 
 
 		 303 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3167  hypothetical protein  28.03 
 
 		 298 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3630  hypothetical protein  28.03 
 
 		 300 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2810  hypothetical protein  28.03 
 
 		 298 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1733  hypothetical protein  28.03 
 
 		 298 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0033  hypothetical protein  28.03 
 
 		 298 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3581  hypothetical protein  26.45 
 
 		 323 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2608  hypothetical protein  27.87 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0497  hypothetical protein  27.87 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1797  hypothetical protein  26.79 
 
 		 273 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.534561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  25.48 
 
 		 273 aa  90.1  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0402  hypothetical protein  27.87 
 
 		 303 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2456  hypothetical protein  26.29 
 
 		 277 aa  90.1  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1388  hypothetical protein  28.15 
 
 		 316 aa  90.1  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0707  hypothetical protein  27.1 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3585  hypothetical protein  26.57 
 
 		 295 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2900  hypothetical protein  26.2 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320076  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  26.57 
 
 		 316 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3157  hypothetical protein  28.1 
 
 		 278 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0871  hypothetical protein  26.05 
 
 		 285 aa  87  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  26.12 
 
 		 280 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  25.75 
 
 		 280 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0470  hypothetical protein  27.16 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0532  hypothetical protein  27.48 
 
 		 307 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2930  hypothetical protein  27.54 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.778449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5571  hypothetical protein  28.75 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50373  predicted protein  32.38 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4150  hypothetical protein  31.91 
 
 		 220 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2534  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>