17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4150 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4150  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  430  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2031  hypothetical protein  72.81 
 
 
218 aa  309  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000492464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2196  hypothetical protein  71.43 
 
 
218 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2534  hypothetical protein  74.19 
 
 
237 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1375  hypothetical protein  79.72 
 
 
224 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.658596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2633  hypothetical protein  73.73 
 
 
218 aa  270  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00651403  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50373  predicted protein  32.49 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  33.52 
 
 
376 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  34.24 
 
 
401 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  33.61 
 
 
277 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  33.92 
 
 
400 aa  48.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  26.26 
 
 
404 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  27.62 
 
 
411 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  30.1 
 
 
411 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  32.2 
 
 
407 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  27.98 
 
 
413 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  28.57 
 
 
316 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>