21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1375 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1375  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.658596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2031  hypothetical protein  71.89 
 
 		 218 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000492464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2196  hypothetical protein  71.43 
 
 		 218 aa  298  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2534  hypothetical protein  76.5 
 
 		 237 aa  295  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4150  hypothetical protein  79 
 
 		 220 aa  278  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2633  hypothetical protein  71.56 
 
 		 218 aa  262  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00651403  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50373  predicted protein  34.85 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  33.87 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  35.88 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  33.51 
 
 		 401 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  31.43 
 
 		 411 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  35.54 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  26.17 
 
 		 453 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  27.43 
 
 		 411 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  28.65 
 
 		 413 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  33.03 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  32.97 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  31.64 
 
 		 392 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  34.22 
 
 		 283 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  34.62 
 
 		 316 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>