88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3564 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  836    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  45.35 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0414  SAM-dependent methyltransferase  40.34 
 
 		 394 aa  292  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.675076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  41.16 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  39.61 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  40.44 
 
 		 399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  40.44 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  40.68 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  40.19 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  37.14 
 
 		 404 aa  283  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  40 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  40.69 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1046  hypothetical protein  40.39 
 
 		 409 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  39.95 
 
 		 410 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4406  hypothetical protein  40.39 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4318  hypothetical protein  39.66 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3246  hypothetical protein  39.07 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  37 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46056  predicted protein  41.34 
 
 		 612 aa  223  6e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3589  hypothetical protein  35.58 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  32.6 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  34.26 
 
 		 401 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  32.99 
 
 		 407 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  32.05 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  33.12 
 
 		 453 aa  169  8e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  33.16 
 
 		 392 aa  159  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  29.18 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  34.07 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  29.59 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  29.18 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3162  SAM dependent methyltransferase  29.93 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  33.06 
 
 		 389 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1797  hypothetical protein  38.61 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.534561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1150  hypothetical protein  38.65 
 
 		 294 aa  106  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2930  hypothetical protein  35.18 
 
 		 286 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.778449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  32.13 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  34.29 
 
 		 276 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5571  hypothetical protein  33.8 
 
 		 290 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  30.39 
 
 		 316 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0707  hypothetical protein  36.95 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  33.85 
 
 		 273 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1006  hypothetical protein  37.91 
 
 		 320 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1733  hypothetical protein  35.92 
 
 		 298 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2810  hypothetical protein  35.92 
 
 		 298 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0033  hypothetical protein  35.92 
 
 		 298 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3581  hypothetical protein  35.15 
 
 		 323 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3167  hypothetical protein  35.92 
 
 		 298 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3630  hypothetical protein  35.92 
 
 		 300 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0532  hypothetical protein  38.92 
 
 		 307 aa  97.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3605  hypothetical protein  35.92 
 
 		 300 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3617  hypothetical protein  35.92 
 
 		 300 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  33.98 
 
 		 298 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0402  hypothetical protein  33.19 
 
 		 303 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3585  hypothetical protein  33.63 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0428  hypothetical protein  33.19 
 
 		 303 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0470  hypothetical protein  34.6 
 
 		 296 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2608  hypothetical protein  33.19 
 
 		 296 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0497  hypothetical protein  33.19 
 
 		 296 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0871  hypothetical protein  35.11 
 
 		 285 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  35.2 
 
 		 280 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  35.2 
 
 		 280 aa  93.2  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2900  hypothetical protein  33.19 
 
 		 296 aa  92.8  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320076  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0682  hypothetical protein  36.5 
 
 		 294 aa  93.2  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.189745  normal  0.58708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1388  hypothetical protein  33.68 
 
 		 316 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  33.17 
 
 		 280 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  32.7 
 
 		 283 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  33.17 
 
 		 283 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  34.83 
 
 		 277 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3601  hypothetical protein  31.37 
 
 		 278 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4678  hypothetical protein  31.37 
 
 		 278 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3157  hypothetical protein  31.82 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.58 
 
 		 222 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93465  predicted protein  25.94 
 
 		 278 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 234 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3657  SAM-dependent methyltransferase  33.66 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.799058  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  44 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4741  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.168171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50474  predicted protein  29.46 
 
 		 747 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0241823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  34.21 
 
 		 246 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  37.31 
 
 		 261 aa  43.5  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.34 
 
 		 222 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.34 
 
 		 222 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  37.31 
 
 		 261 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  37.31 
 
 		 261 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  28.46 
 
 		 468 aa  43.1  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>