21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2633 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2633  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00651403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2031  hypothetical protein  73.27 
 
 		 218 aa  315  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000492464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2196  hypothetical protein  73.27 
 
 		 218 aa  314  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144783  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2534  hypothetical protein  72.81 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4150  hypothetical protein  73.73 
 
 		 220 aa  258  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1375  hypothetical protein  71.56 
 
 		 224 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.658596  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50373  predicted protein  34.85 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  37.06 
 
 		 400 aa  55.5  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  33.52 
 
 		 376 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  32.38 
 
 		 411 aa  52.8  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  29.38 
 
 		 411 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  28.24 
 
 		 413 aa  48.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  24.86 
 
 		 388 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  24.86 
 
 		 388 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  32.31 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  29.61 
 
 		 401 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  27.34 
 
 		 406 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  29.78 
 
 		 392 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  25.15 
 
 		 423 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  25.62 
 
 		 404 aa  41.6  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  27.64 
 
 		 406 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>