16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2031 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2031  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000492464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2196  hypothetical protein  94.5 
 
 		 218 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2633  hypothetical protein  73.27 
 
 		 218 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00651403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2534  hypothetical protein  69.12 
 
 		 237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4150  hypothetical protein  72.81 
 
 		 220 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1375  hypothetical protein  71.89 
 
 		 224 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.658596  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50373  predicted protein  32.65 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  32.08 
 
 		 411 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  35.09 
 
 		 400 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  27.12 
 
 		 420 aa  45.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0414  SAM-dependent methyltransferase  24.73 
 
 		 394 aa  45.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.675076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  24.88 
 
 		 378 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  36.79 
 
 		 376 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  32.45 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  31.75 
 
 		 280 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  27.06 
 
 		 413 aa  42  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>