20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2534 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2534  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2031  hypothetical protein  69.12 
 
 		 218 aa  298  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000492464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2196  hypothetical protein  68.66 
 
 		 218 aa  293  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1375  hypothetical protein  76.5 
 
 		 224 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.658596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2633  hypothetical protein  72.81 
 
 		 218 aa  271  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00651403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4150  hypothetical protein  74.19 
 
 		 220 aa  265  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50373  predicted protein  33.64 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  30.77 
 
 		 411 aa  48.9  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  25.62 
 
 		 389 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  28.81 
 
 		 376 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  32.75 
 
 		 400 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  32.78 
 
 		 407 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  30.84 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  30.17 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  33.87 
 
 		 392 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  25.29 
 
 		 399 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  25.29 
 
 		 399 aa  42  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  25.29 
 
 		 399 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  25.29 
 
 		 399 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  25.29 
 
 		 401 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>