75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3723 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  845    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  42.32 
 
 		 388 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  42.25 
 
 		 388 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  41.08 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  38.05 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  32.28 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  32.72 
 
 		 378 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3162  SAM dependent methyltransferase  37.69 
 
 		 389 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0414  SAM-dependent methyltransferase  31.5 
 
 		 394 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.675076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  34.53 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  32.43 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1046  hypothetical protein  31.11 
 
 		 409 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  31.32 
 
 		 423 aa  193  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4318  hypothetical protein  31.03 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  32.67 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4406  hypothetical protein  33.75 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3246  hypothetical protein  29.92 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  32.57 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  30.45 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  31.71 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  31.71 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  32.29 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  31.21 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  29.79 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  30.64 
 
 		 406 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3589  hypothetical protein  30.12 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  30.35 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  29.81 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  33.71 
 
 		 407 aa  176  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  30.45 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  34.07 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  29.35 
 
 		 453 aa  153  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46056  predicted protein  30.42 
 
 		 612 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1388  hypothetical protein  31.66 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0682  hypothetical protein  29.06 
 
 		 294 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.189745  normal  0.58708 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  32.32 
 
 		 298 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  29.92 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1797  hypothetical protein  28.62 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.534561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  30.84 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  31.28 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3630  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  30.45 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  30.84 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3167  hypothetical protein  31.37 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3605  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2810  hypothetical protein  31.37 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1733  hypothetical protein  31.37 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0033  hypothetical protein  31.37 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3617  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2456  hypothetical protein  28.79 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2608  hypothetical protein  30.94 
 
 		 296 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0497  hypothetical protein  30.94 
 
 		 296 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0871  hypothetical protein  29.23 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0402  hypothetical protein  30.29 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  30.45 
 
 		 280 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2900  hypothetical protein  29.1 
 
 		 296 aa  110  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320076  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0470  hypothetical protein  30.94 
 
 		 296 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0428  hypothetical protein  30.29 
 
 		 303 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3585  hypothetical protein  29.14 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3157  hypothetical protein  31.12 
 
 		 278 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  29.96 
 
 		 277 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4678  hypothetical protein  29.23 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3601  hypothetical protein  29.23 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2930  hypothetical protein  28.34 
 
 		 286 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.778449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1150  hypothetical protein  27.86 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1006  hypothetical protein  27.57 
 
 		 320 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0707  hypothetical protein  27.98 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  28.57 
 
 		 277 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5571  hypothetical protein  27.55 
 
 		 290 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  27.34 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  25.65 
 
 		 316 aa  97.1  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3581  hypothetical protein  27.2 
 
 		 323 aa  96.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 307 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2633  hypothetical protein  37.76 
 
 		 218 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00651403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4150  hypothetical protein  35.51 
 
 		 220 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>