74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3157 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3157  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  577  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3601  hypothetical protein  91.37 
 
 		 278 aa  537  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4678  hypothetical protein  91.37 
 
 		 278 aa  537  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  85 
 
 		 280 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  85.41 
 
 		 280 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  83.81 
 
 		 276 aa  497  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2900  hypothetical protein  84.34 
 
 		 296 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320076  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2608  hypothetical protein  84.23 
 
 		 296 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0497  hypothetical protein  84.23 
 
 		 296 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  84.53 
 
 		 298 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3585  hypothetical protein  82.92 
 
 		 295 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0470  hypothetical protein  83.87 
 
 		 296 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0402  hypothetical protein  83.87 
 
 		 303 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0428  hypothetical protein  83.51 
 
 		 303 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3167  hypothetical protein  83.75 
 
 		 298 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3605  hypothetical protein  83.75 
 
 		 300 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1733  hypothetical protein  83.75 
 
 		 298 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0033  hypothetical protein  83.75 
 
 		 298 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3630  hypothetical protein  83.75 
 
 		 300 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2810  hypothetical protein  83.75 
 
 		 298 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3617  hypothetical protein  83.75 
 
 		 300 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2456  hypothetical protein  82.05 
 
 		 277 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0871  hypothetical protein  80.73 
 
 		 285 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1388  hypothetical protein  70.33 
 
 		 316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0682  hypothetical protein  71 
 
 		 294 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.189745  normal  0.58708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  68.15 
 
 		 273 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  68 
 
 		 316 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3581  hypothetical protein  68.36 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2930  hypothetical protein  67.78 
 
 		 286 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.778449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  72.65 
 
 		 277 aa  364  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1797  hypothetical protein  66.54 
 
 		 273 aa  361  6e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.534561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1006  hypothetical protein  66.79 
 
 		 320 aa  358  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1150  hypothetical protein  63.97 
 
 		 294 aa  348  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5571  hypothetical protein  65.9 
 
 		 290 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0707  hypothetical protein  64.94 
 
 		 309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0532  hypothetical protein  62.83 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  49.04 
 
 		 283 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  49.04 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  48.66 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  48.89 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  34 
 
 		 400 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  34.91 
 
 		 411 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3162  SAM dependent methyltransferase  29.82 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  28.52 
 
 		 389 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  32.75 
 
 		 404 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0414  SAM-dependent methyltransferase  31.14 
 
 		 394 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.675076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  30.65 
 
 		 406 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  33.01 
 
 		 378 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  29.58 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  29.58 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  29.58 
 
 		 399 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  31.12 
 
 		 411 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  30.12 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  29.58 
 
 		 401 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  30.12 
 
 		 388 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  29.58 
 
 		 399 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  29.75 
 
 		 399 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1046  hypothetical protein  29.17 
 
 		 409 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46056  predicted protein  28.36 
 
 		 612 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268711  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4406  hypothetical protein  29.55 
 
 		 404 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  30.23 
 
 		 406 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4318  hypothetical protein  29.5 
 
 		 404 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  32.3 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3246  hypothetical protein  30.36 
 
 		 444 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  31.65 
 
 		 401 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  29.82 
 
 		 388 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  30.36 
 
 		 410 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  34.43 
 
 		 376 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3589  hypothetical protein  31.45 
 
 		 401 aa  96.3  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  31.28 
 
 		 392 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  31.82 
 
 		 413 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  28.1 
 
 		 407 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  26.94 
 
 		 453 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68100  hypothetical protein  28.8 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000176294  normal  0.0238566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>