76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4406 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1046  hypothetical protein  92.33 
 
 		 409 aa  770    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4318  hypothetical protein  96.29 
 
 		 404 aa  801    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4406  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  833    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  69.5 
 
 		 406 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  68.41 
 
 		 406 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  68.19 
 
 		 410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  62.6 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  62.6 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  61.98 
 
 		 399 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  62.6 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  62.24 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  60.93 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3246  hypothetical protein  56.28 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  54.95 
 
 		 423 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0414  SAM-dependent methyltransferase  42.64 
 
 		 394 aa  295  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.675076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  38.79 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  37 
 
 		 404 aa  272  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  40.39 
 
 		 413 aa  267  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  33.06 
 
 		 400 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  35.64 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  33.75 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46056  predicted protein  35.67 
 
 		 612 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  30.81 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3589  hypothetical protein  32.58 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2704 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  30.52 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  29.26 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  30.47 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3162  SAM dependent methyltransferase  31.07 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  32.51 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  29.91 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  31.25 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  0.00000434601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  30.63 
 
 		 401 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  31.79 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1006  hypothetical protein  31.92 
 
 		 320 aa  113  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  31.42 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1150  hypothetical protein  32.18 
 
 		 294 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2456  hypothetical protein  29.69 
 
 		 277 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0707  hypothetical protein  30.5 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1388  hypothetical protein  30.3 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5571  hypothetical protein  30.71 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3581  hypothetical protein  29.66 
 
 		 323 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0871  hypothetical protein  30.57 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  32.83 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0532  hypothetical protein  32.76 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  28.85 
 
 		 276 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  32.83 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1797  hypothetical protein  29.58 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.534561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  32.45 
 
 		 283 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0682  hypothetical protein  31.47 
 
 		 294 aa  106  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.189745  normal  0.58708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2930  hypothetical protein  31.91 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.778449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3630  hypothetical protein  29.74 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0402  hypothetical protein  30.54 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3605  hypothetical protein  29.74 
 
 		 300 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3167  hypothetical protein  29.74 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2810  hypothetical protein  29.74 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1733  hypothetical protein  29.74 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0033  hypothetical protein  29.74 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3617  hypothetical protein  29.74 
 
 		 300 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0428  hypothetical protein  30.54 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  29.74 
 
 		 277 aa  103  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2900  hypothetical protein  30.13 
 
 		 296 aa  103  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320076  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3157  hypothetical protein  29.55 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  29.36 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  28.94 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0470  hypothetical protein  29.71 
 
 		 296 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3585  hypothetical protein  29.71 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2608  hypothetical protein  30.42 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4678  hypothetical protein  28.16 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3601  hypothetical protein  28.16 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0497  hypothetical protein  30.42 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  28.82 
 
 		 298 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  31.23 
 
 		 277 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  28.02 
 
 		 273 aa  93.2  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1368  hypothetical protein  28.48 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.11 
 
 		 282 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  30.53 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>