More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1499 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
99 aa  199  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  85.86 
 
 
99 aa  176  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  84.85 
 
 
99 aa  176  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  84.85 
 
 
99 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  83.84 
 
 
99 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  83.84 
 
 
99 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  83.84 
 
 
99 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  82.83 
 
 
99 aa  174  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  83.84 
 
 
99 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  83.84 
 
 
99 aa  174  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  80.81 
 
 
99 aa  173  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  83.84 
 
 
99 aa  173  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  80.81 
 
 
99 aa  170  6e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  80.81 
 
 
99 aa  170  6e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  79.8 
 
 
99 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  74.49 
 
 
100 aa  160  5e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  76.77 
 
 
98 aa  154  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  71.72 
 
 
123 aa  145  1e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  69.39 
 
 
96 aa  132  1e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  66.33 
 
 
103 aa  132  2e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  61.22 
 
 
104 aa  129  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  60.61 
 
 
97 aa  129  2e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  58.59 
 
 
99 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  57.89 
 
 
99 aa  127  7e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  57.58 
 
 
99 aa  126  9e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  59.6 
 
 
104 aa  125  2e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  58.33 
 
 
102 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52883e-05 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  59.18 
 
 
94 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  57.89 
 
 
99 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  56.7 
 
 
104 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  56.7 
 
 
104 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  58.59 
 
 
98 aa  120  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  56.12 
 
 
94 aa  117  5e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  54.55 
 
 
106 aa  117  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  58.95 
 
 
99 aa  108  4e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  56.12 
 
 
268 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  51.52 
 
 
111 aa  107  8e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  62.34 
 
 
88 aa  105  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  46.46 
 
 
106 aa  103  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  55.79 
 
 
99 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  51.04 
 
 
106 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  51.04 
 
 
106 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  47.42 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  59.26 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  45.45 
 
 
105 aa  93.6  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  40.4 
 
 
121 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  42.71 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  42.71 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  47.13 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  47.13 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  44.33 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.66855e-11  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  40.4 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  42.27 
 
 
122 aa  88.2  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
98 aa  87  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  43.3 
 
 
105 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  47.73 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  46.39 
 
 
107 aa  82.8  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  47.89 
 
 
350 aa  81.3  4e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  40.86 
 
 
200 aa  80.9  6e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  41.67 
 
 
193 aa  80.1  9e-15  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  42.17 
 
 
356 aa  79.7  1e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  40.91 
 
 
89 aa  79.3  2e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  39.77 
 
 
101 aa  78.2  3e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  54.29 
 
 
351 aa  78.2  4e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  42.55 
 
 
93 aa  77.4  6e-14  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  36.73 
 
 
121 aa  77  8e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  36.73 
 
 
124 aa  75.9  2e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  37.76 
 
 
122 aa  75.5  2e-13  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  48.75 
 
 
108 aa  75.1  3e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  45.35 
 
 
193 aa  75.1  3e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  48.75 
 
 
108 aa  75.1  3e-13  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  52.11 
 
 
356 aa  74.7  4e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  52.11 
 
 
356 aa  74.7  4e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  52.11 
 
 
356 aa  74.7  4e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  52.86 
 
 
129 aa  74.7  4e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  52.11 
 
 
356 aa  74.7  4e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  42.86 
 
 
94 aa  73.9  6e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  39.53 
 
 
366 aa  73.9  6e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  47.5 
 
 
356 aa  74.3  6e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.57 
 
 
352 aa  73.9  7e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  42.27 
 
 
358 aa  73.9  7e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.57 
 
 
357 aa  73.6  9e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  38.14 
 
 
121 aa  73.6  9e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  1.03216e-06 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.05 
 
 
365 aa  73.6  9e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  36.73 
 
 
125 aa  72.8  1e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  40.59 
 
 
108 aa  72.8  1e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  38.14 
 
 
124 aa  72.8  1e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  39.39 
 
 
113 aa  72  2e-12  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  48.68 
 
 
358 aa  72  2e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  42.5 
 
 
358 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.54 
 
 
348 aa  72  3e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  54.17 
 
 
336 aa  71.6  3e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  49.3 
 
 
681 aa  71.6  3e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4468  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44.58 
 
 
369 aa  71.2  4e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.488012  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.9 
 
 
351 aa  71.2  5e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  43.42 
 
 
357 aa  70.9  5e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4069  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44.58 
 
 
369 aa  71.2  5e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  48 
 
 
360 aa  71.2  5e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>