More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0881 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0881  prephenate dehydratase  100 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  54.61 
 
 		 295 aa  292  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  51.6 
 
 		 287 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  53.76 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  53.76 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  50 
 
 		 296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  53.02 
 
 		 293 aa  276  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4418  prephenate dehydratase  55.36 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16951  chorismate mutase-prephenate dehydratase  45.34 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17071  chorismate mutase-prephenate dehydratase  43.72 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.530579  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0316  prephenate dehydratase  45.55 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1596  chorismate mutase-prephenate dehydratase  45.53 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1070  chorismate mutase-prephenate dehydratase  46.34 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.330771  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16841  chorismate mutase-prephenate dehydratase  43.6 
 
 		 281 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  43.8 
 
 		 280 aa  208  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16271  chorismate mutase-prephenate dehydratase  42.5 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23691  chorismate mutase-prephenate dehydratase  44.8 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0614249 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2026  prephenate dehydratase  43.53 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.713159  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19451  chorismate mutase-prephenate dehydratase  46.37 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  36.62 
 
 		 303 aa  192  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  35 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.71 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  40.29 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  35.04 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  39.34 
 
 		 359 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  38.91 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  37.32 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  39.64 
 
 		 386 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  34.75 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  38.43 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  38.43 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  41.76 
 
 		 360 aa  175  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  39.93 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  38.79 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1644  Prephenate dehydratase  40.44 
 
 		 355 aa  169  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.241055  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  40.96 
 
 		 360 aa  168  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 358 aa  168  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.01 
 
 		 365 aa  168  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.59 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  41.91 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  35.61 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  39.48 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  34.93 
 
 		 356 aa  166  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  38.1 
 
 		 364 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  35.66 
 
 		 377 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.6 
 
 		 358 aa  165  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  40.28 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  39.16 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.87 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.87 
 
 		 368 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  38.18 
 
 		 372 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  35.61 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  37.73 
 
 		 367 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  37.73 
 
 		 364 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  33.68 
 
 		 311 aa  162  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  36.96 
 
 		 374 aa  161  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  38.32 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  37 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  37.36 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  39.21 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.24 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  38.18 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0499  prephenate dehydratase  32.74 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  36.73 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  39.93 
 
 		 363 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  35.14 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  36.4 
 
 		 355 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  35.59 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  35.71 
 
 		 366 aa  158  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  37.77 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.32 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  39.36 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.18 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  35.66 
 
 		 418 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  37.87 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.26 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  37.32 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  36.07 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.53 
 
 		 364 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  35.53 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  35.16 
 
 		 364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.97 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  34.31 
 
 		 359 aa  155  7e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  36.07 
 
 		 371 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.07 
 
 		 371 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  35.9 
 
 		 366 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.59 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  40.36 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.34 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  35.84 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>