116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0023 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  100 
 
 
354 aa  679  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  68.25 
 
 
363 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  60.67 
 
 
363 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  60.22 
 
 
364 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  56.75 
 
 
365 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  56.75 
 
 
365 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  59.18 
 
 
372 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  59.35 
 
 
356 aa  357  2e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  51.82 
 
 
358 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  57.64 
 
 
367 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  45.8 
 
 
348 aa  283  3e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  6.2591e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  46.63 
 
 
370 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  45.8 
 
 
348 aa  272  5e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  45 
 
 
354 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  42.05 
 
 
416 aa  266  5e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  44.77 
 
 
366 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  42.22 
 
 
370 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  1.50317e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  47.88 
 
 
354 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  47.14 
 
 
360 aa  253  4e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.77 
 
 
349 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  41 
 
 
434 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  42.98 
 
 
350 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  42.57 
 
 
350 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  46.42 
 
 
358 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  42.49 
 
 
351 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  45.21 
 
 
331 aa  226  5e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  41.91 
 
 
354 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  41.57 
 
 
354 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  41.91 
 
 
351 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  41.94 
 
 
351 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  41.91 
 
 
351 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  41.91 
 
 
354 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  41.62 
 
 
354 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  41.62 
 
 
354 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  41.08 
 
 
351 aa  222  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  42.49 
 
 
351 aa  221  1e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  42.69 
 
 
379 aa  221  1e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.83 
 
 
351 aa  221  2e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  44.85 
 
 
374 aa  220  4e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  46.2 
 
 
356 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  37.89 
 
 
544 aa  213  3e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  41.55 
 
 
367 aa  208  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  43.77 
 
 
381 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.21 
 
 
364 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  36.36 
 
 
348 aa  205  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  39.04 
 
 
361 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  36.09 
 
 
403 aa  185  9e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  41.41 
 
 
388 aa  182  5e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  32.52 
 
 
324 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  38.81 
 
 
689 aa  122  1e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  42.35 
 
 
742 aa  118  1e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  37.33 
 
 
599 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  30.16 
 
 
481 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  34.27 
 
 
365 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  50 
 
 
189 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  25.82 
 
 
377 aa  67.4  3e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 
1344 aa  66.2  9e-10  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  35.59 
 
 
1129 aa  65.9  1e-09  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  26.8 
 
 
368 aa  64.7  2e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  29.88 
 
 
360 aa  62.8  8e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  25.81 
 
 
377 aa  59.7  7e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  28.57 
 
 
967 aa  59.7  8e-08  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  21.51 
 
 
363 aa  56.6  6e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  21.53 
 
 
367 aa  55.8  1e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  21.32 
 
 
365 aa  55.1  2e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  27.9 
 
 
392 aa  53.1  7e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  26.38 
 
 
360 aa  52.8  9e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  28.17 
 
 
362 aa  50.4  4e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  28.48 
 
 
362 aa  50.1  5e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  26.56 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  28.35 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  28.27 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2332  calcium/sodium:proton antiporter  24.62 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  27.2 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  27.59 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  27.2 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  27.2 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  26.38 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  28.35 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6768  sodium/calcium exchanger membrane region  26.74 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  28.35 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  26.56 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  28.48 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  25.98 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  28.12 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  27 
 
 
366 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  27.9 
 
 
361 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  27.9 
 
 
361 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  25.7 
 
 
365 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  27 
 
 
366 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  27 
 
 
366 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  28.66 
 
 
380 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  27.95 
 
 
362 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  27.95 
 
 
362 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  21.36 
 
 
385 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  27.42 
 
 
371 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  26.36 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.154529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  25.6 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  26.5 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  26.5 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  2.27831e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>