More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0999 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  66.22 
 
 		 684 aa  984    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 679 aa  1394    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  44.14 
 
 		 687 aa  586  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  43.57 
 
 		 694 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  43.26 
 
 		 679 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  44.98 
 
 		 678 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  43.85 
 
 		 676 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  42.73 
 
 		 686 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  41.62 
 
 		 676 aa  551  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  42.06 
 
 		 676 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  42.06 
 
 		 678 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  38.3 
 
 		 681 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  37.15 
 
 		 682 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  37.81 
 
 		 682 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  37.32 
 
 		 684 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  36.92 
 
 		 682 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  36.43 
 
 		 681 aa  439  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  43.76 
 
 		 686 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  42.94 
 
 		 689 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  42.54 
 
 		 670 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  43.47 
 
 		 703 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  41.35 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  39.92 
 
 		 675 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  32.62 
 
 		 531 aa  240  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  31.46 
 
 		 508 aa  238  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  32.21 
 
 		 470 aa  219  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  29.85 
 
 		 469 aa  213  9e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  29.03 
 
 		 477 aa  198  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  27.72 
 
 		 473 aa  162  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  28.33 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  27.16 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  28.82 
 
 		 186 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  23.78 
 
 		 815 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  27.44 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  27.44 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  27.45 
 
 		 781 aa  62  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  25.42 
 
 		 817 aa  61.6  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  27.44 
 
 		 793 aa  61.2  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  25.97 
 
 		 813 aa  60.8  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  25.95 
 
 		 811 aa  60.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  25.33 
 
 		 805 aa  60.1  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  26.14 
 
 		 775 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  24.16 
 
 		 797 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  26.9 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  23.81 
 
 		 823 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  27.33 
 
 		 775 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  27.4 
 
 		 874 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  26.21 
 
 		 785 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  26.14 
 
 		 800 aa  59.7  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  26.62 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  27.4 
 
 		 875 aa  59.3  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  22.91 
 
 		 898 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  25.66 
 
 		 778 aa  58.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0317  ATP-dependent protease La  25.28 
 
 		 817 aa  58.5  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  23.6 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  25.61 
 
 		 793 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  26.14 
 
 		 785 aa  58.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  24.34 
 
 		 804 aa  58.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  26.49 
 
 		 675 aa  57.8  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  26.21 
 
 		 785 aa  57.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  26.21 
 
 		 785 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  22.98 
 
 		 825 aa  57.8  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  22.56 
 
 		 812 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  24.44 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  25 
 
 		 799 aa  57.4  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  22.56 
 
 		 812 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  24.39 
 
 		 805 aa  57.4  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  22.99 
 
 		 783 aa  57  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 799 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 		 811 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  25.61 
 
 		 808 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  27.22 
 
 		 776 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  26.21 
 
 		 785 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  26.21 
 
 		 785 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  26.21 
 
 		 785 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 		 796 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  25.69 
 
 		 806 aa  56.6  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  25.52 
 
 		 785 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  25.61 
 
 		 807 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.33 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  23.64 
 
 		 856 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  25.52 
 
 		 785 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  25.52 
 
 		 785 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  25.69 
 
 		 806 aa  56.2  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  21.47 
 
 		 880 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  23.88 
 
 		 797 aa  56.2  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  25.49 
 
 		 783 aa  55.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  24.39 
 
 		 802 aa  56.2  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>