More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3492 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3492  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
390 aa  754    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.695394  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0645  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 
389 aa  233  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.924062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  40.13 
 
 
435 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  41.12 
 
 
464 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
442 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  36.65 
 
 
433 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3491  glycosyl transferase, group 1  37.35 
 
 
440 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76367  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 
423 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
428 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  29.81 
 
 
430 aa  149  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  37.99 
 
 
382 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  44.3 
 
 
366 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  38.06 
 
 
431 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 
398 aa  136  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 
380 aa  132  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
395 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
343 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  38.93 
 
 
370 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  39.16 
 
 
382 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
434 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 
400 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
371 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
381 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
361 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 
370 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3765  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  38.15 
 
 
408 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
397 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 
384 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  35.04 
 
 
380 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  44.51 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.59 
 
 
376 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  31.03 
 
 
372 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  31.03 
 
 
372 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
381 aa  113  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  33.46 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  35.92 
 
 
343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  35.19 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  34.12 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.23 
 
 
361 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  36.23 
 
 
361 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.23 
 
 
401 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.23 
 
 
414 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.23 
 
 
414 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.23 
 
 
414 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.23 
 
 
414 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
364 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  35.66 
 
 
364 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
346 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  32.16 
 
 
336 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  35 
 
 
346 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  34.81 
 
 
375 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
378 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
387 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
387 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
374 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
361 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
364 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
377 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  32.69 
 
 
353 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  35.49 
 
 
394 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.6 
 
 
364 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
358 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
373 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
420 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
360 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
360 aa  103  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
372 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
390 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
373 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
370 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
355 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  38.06 
 
 
379 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
398 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  30.31 
 
 
364 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
366 aa  99.8  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
375 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0340  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0102921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.82 
 
 
351 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
340 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  30.6 
 
 
375 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
372 aa  96.7  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
388 aa  96.7  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
359 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
359 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>