198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2524 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2524  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.22 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  44.2 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  49.33 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  47.14 
 
 		 246 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  41.85 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  40.97 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  46.85 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  45.54 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  48.23 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  45.33 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.93 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.93 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.93 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  45.98 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.74 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  45.78 
 
 		 225 aa  178  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  41.56 
 
 		 228 aa  178  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  41.96 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.15 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  44.49 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  47.79 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.98 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  45.54 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  45.58 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.14 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  45.98 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.05 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.44 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  42.36 
 
 		 260 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.36 
 
 		 260 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.33 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.88 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  47.77 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.89 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.3 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.3 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.36 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  44 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.42 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  43.3 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  43.67 
 
 		 230 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3847  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.46 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.92 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  47.32 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  47.32 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  47.32 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  47.32 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  47.32 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  47.32 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  47.32 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  44.2 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.89 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  45.61 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  43.86 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  43.56 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  44.89 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  42.36 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  41.96 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  47.58 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  44.16 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  43.44 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.73 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  43.06 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.11 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  43.1 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  39.21 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  40.53 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  43.44 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.86 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.02 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  41.52 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  38.84 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  43.89 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  38.39 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  42.58 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  38.77 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  40.97 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.86 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.91 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.81 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  44.93 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  42.72 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  38.77 
 
 		 229 aa  155  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.67 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  47.11 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.3 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  46.88 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  41.52 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.72 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.32 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  38.67 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  39.91 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  35.19 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  35.06 
 
 		 227 aa  147  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  34.48 
 
 		 229 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  34.91 
 
 		 229 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  38.16 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  41.96 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>