298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_07620  predicted metal-dependent hydrolase  100 
 
 
201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.966751  normal  0.648637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  70.76 
 
 
175 aa  241  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3802  protein of unknown function DUF45  61.21 
 
 
191 aa  187  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7934  protein of unknown function DUF45  59.51 
 
 
180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2959  hypothetical protein  58.54 
 
 
213 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0212989  normal  0.321513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27520  predicted metal-dependent hydrolase  52.6 
 
 
203 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3736  protein of unknown function DUF45  57.59 
 
 
174 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4225  protein of unknown function DUF45  55.7 
 
 
173 aa  169  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8351  metal-dependent hydrolase-like protein  56.1 
 
 
171 aa  167  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4114  hypothetical protein  57.62 
 
 
172 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26654  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1523  hypothetical protein  56.97 
 
 
170 aa  161  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0533  metal-dependent hydrolase  51.79 
 
 
210 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3733  hypothetical protein  56.86 
 
 
172 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.586168  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1185  protein of unknown function DUF45  55.41 
 
 
258 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.149779 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0720  protein of unknown function DUF45  50.34 
 
 
206 aa  155  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4380  hypothetical protein  50.94 
 
 
178 aa  154  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2465  protein of unknown function DUF45  51.7 
 
 
236 aa  151  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0731519  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0790  protein of unknown function DUF45  55 
 
 
184 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1766  hypothetical protein  51.18 
 
 
241 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2474  protein of unknown function DUF45  49.69 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000651268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2752  hypothetical protein  49.04 
 
 
211 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2891  protein of unknown function DUF45  49.34 
 
 
208 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00416901  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11430  predicted metal-dependent hydrolase  44.44 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0278  hypothetical protein  39.02 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19100  predicted metal-dependent hydrolase  40.12 
 
 
198 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.155698  normal  0.193452 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15040  predicted metal-dependent hydrolase  42.86 
 
 
222 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  31.21 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  31.82 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  45.57 
 
 
245 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  47.89 
 
 
241 aa  58.9  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3318  hypothetical protein  41.79 
 
 
196 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  48.08 
 
 
227 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  46.97 
 
 
270 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  31.17 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  38.1 
 
 
318 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  35.14 
 
 
340 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  42.86 
 
 
242 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  39.74 
 
 
261 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  48.08 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  35.59 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  41.51 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  49.21 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  49.15 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  46.15 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  39.73 
 
 
235 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  41.03 
 
 
249 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  39.29 
 
 
222 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  42.35 
 
 
314 aa  55.1  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  45.9 
 
 
292 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  45.9 
 
 
292 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  29.71 
 
 
184 aa  55.1  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  39.73 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  37.19 
 
 
310 aa  55.1  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  39.29 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  45.9 
 
 
288 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  45.16 
 
 
243 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  45.16 
 
 
247 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  31.82 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  50.98 
 
 
286 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  39.08 
 
 
278 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  38.55 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  40.54 
 
 
259 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  43.55 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  39.13 
 
 
279 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  49.02 
 
 
300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  31.97 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  44.26 
 
 
300 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0228  hypothetical protein  44.62 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  38.16 
 
 
251 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  40.68 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0259  hypothetical protein  41.67 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  50.98 
 
 
292 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  45.9 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2928  hypothetical protein  26.5 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  43.28 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  42.62 
 
 
301 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  38.27 
 
 
227 aa  52.4  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  41.07 
 
 
236 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  42.62 
 
 
295 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  42.62 
 
 
292 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  42.62 
 
 
316 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  40.38 
 
 
243 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  44.78 
 
 
244 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  42.62 
 
 
295 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  42.62 
 
 
295 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  44.23 
 
 
244 aa  52  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  42.62 
 
 
285 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  42.62 
 
 
292 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  42.62 
 
 
292 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  42.62 
 
 
292 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  42.62 
 
 
292 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  42.62 
 
 
295 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  42.62 
 
 
292 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  42.42 
 
 
278 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  37.04 
 
 
306 aa  52  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  34.72 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  42.62 
 
 
303 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  37.04 
 
 
306 aa  52  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  25.5 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>