More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2821 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  50.77 
 
 
2258 aa  1865    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  48.19 
 
 
4268 aa  689    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  45.66 
 
 
2006 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.19 
 
 
6889 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  56.45 
 
 
2350 aa  2169    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  44.26 
 
 
2057 aa  756    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  42.79 
 
 
3293 aa  890    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  37.84 
 
 
1157 aa  728    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  27.62 
 
 
4960 aa  638    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  35.38 
 
 
1497 aa  660    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  33.03 
 
 
2345 aa  901    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  37.65 
 
 
1042 aa  655    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  36.76 
 
 
2619 aa  874    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  34.45 
 
 
3021 aa  965    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  40.72 
 
 
2230 aa  1616    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  45.49 
 
 
1414 aa  783    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  30.27 
 
 
9498 aa  664    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  25.1 
 
 
3695 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  30.19 
 
 
13537 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  30.27 
 
 
6676 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  28.05 
 
 
4968 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  48.65 
 
 
1174 aa  881    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  27.83 
 
 
3308 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  44.99 
 
 
2200 aa  757    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  42.38 
 
 
3875 aa  888    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  42.57 
 
 
1501 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  37.34 
 
 
1157 aa  721    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  42.35 
 
 
1511 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  44.38 
 
 
1457 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  33.54 
 
 
2338 aa  917    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  39.65 
 
 
1862 aa  641    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  46.47 
 
 
1835 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  34.49 
 
 
3002 aa  990    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  43.84 
 
 
1149 aa  756    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  47.2 
 
 
1163 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  43.53 
 
 
1469 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  44.37 
 
 
2035 aa  731    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  40.85 
 
 
3194 aa  736    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  37.63 
 
 
3252 aa  1300    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  33.27 
 
 
2336 aa  913    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  43.16 
 
 
1489 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  30.56 
 
 
3739 aa  841    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  44.94 
 
 
1463 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  48.8 
 
 
1845 aa  677    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  26.25 
 
 
2138 aa  653    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
2174 aa  4276    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  44.15 
 
 
1436 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  43.51 
 
 
1884 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  46.35 
 
 
4165 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  43.4 
 
 
1152 aa  769    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  30.68 
 
 
1837 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  43.27 
 
 
1167 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  47.23 
 
 
1734 aa  714    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  44.21 
 
 
1457 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  35.53 
 
 
1514 aa  717    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  43.27 
 
 
1167 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  40.79 
 
 
2896 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  36.49 
 
 
1193 aa  676    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  29.06 
 
 
5738 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  44.72 
 
 
1438 aa  679    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  42.25 
 
 
2706 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  49.91 
 
 
1131 aa  937    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  47.5 
 
 
1678 aa  896    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  50.44 
 
 
2310 aa  1611    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  46.27 
 
 
1113 aa  825    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  44.21 
 
 
1457 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.11 
 
 
8646 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  43.27 
 
 
1167 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  44.83 
 
 
1837 aa  636  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  27.41 
 
 
4960 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  27.17 
 
 
2193 aa  632  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  30.61 
 
 
4383 aa  633  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  30 
 
 
3470 aa  629  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33.96 
 
 
5953 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  40.13 
 
 
1104 aa  629  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  32.78 
 
 
3650 aa  626  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  28.84 
 
 
2154 aa  622  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  27.15 
 
 
3498 aa  623  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  26.96 
 
 
3291 aa  623  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  30.65 
 
 
6403 aa  622  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  36.75 
 
 
1158 aa  619  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  29.34 
 
 
4747 aa  619  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.88 
 
 
2370 aa  619  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  37.92 
 
 
1487 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  30.24 
 
 
8914 aa  614  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  27.65 
 
 
2156 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  28.73 
 
 
2151 aa  613  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  28.06 
 
 
4502 aa  613  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  28.76 
 
 
2581 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  31.12 
 
 
7712 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  28.85 
 
 
4336 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.13 
 
 
4531 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  27.75 
 
 
2156 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  30.25 
 
 
6176 aa  605  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  25.06 
 
 
4196 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  28.91 
 
 
5213 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.07 
 
 
3432 aa  602  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  25.1 
 
 
3086 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  38.67 
 
 
1897 aa  602  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  30.77 
 
 
4318 aa  601  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>