46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1000 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  352  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  68.52 
 
 		 169 aa  238  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  66.25 
 
 		 171 aa  214  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.74 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  29.45 
 
 		 199 aa  88.2  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.29 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.41 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  25.62 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  25.61 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.33 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  35 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.05 
 
 		 199 aa  77.4  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  23.9 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  27.44 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  25.31 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  25.15 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.46 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.15 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  28.57 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  27.78 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  24.54 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  28.48 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.24 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  23.49 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.84 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  27.67 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  23.31 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  30.99 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  25.77 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  24.55 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  23.78 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  20.61 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.22 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  22.5 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  24.39 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.61 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  26.44 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  26.09 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  22.84 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  22.35 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  31.96 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  28.57 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  25.9 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.58 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  28.41 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.98908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>