More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1674 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
127 aa  255  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  61.98 
 
 
126 aa  154  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  60.63 
 
 
125 aa  154  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 
125 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 
126 aa  142  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 
126 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  54.33 
 
 
126 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  58.54 
 
 
129 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  55.91 
 
 
124 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 
123 aa  142  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  54.47 
 
 
125 aa  141  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  59.52 
 
 
127 aa  141  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  54.03 
 
 
127 aa  140  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 
126 aa  140  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 
128 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 
128 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 
128 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 
128 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 
128 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  56.56 
 
 
128 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  58.06 
 
 
129 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  53.12 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 
128 aa  137  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 
129 aa  137  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  56.56 
 
 
128 aa  136  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  54.92 
 
 
128 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 
128 aa  135  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  54.92 
 
 
128 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
126 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 
127 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 
128 aa  135  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
127 aa  135  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 
141 aa  135  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 
141 aa  135  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 
128 aa  135  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 
126 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 
128 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
128 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  51.2 
 
 
129 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 
128 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 
126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 
129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  51.2 
 
 
129 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
129 aa  134  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  55.28 
 
 
129 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  51.2 
 
 
129 aa  134  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  51.2 
 
 
129 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  53.12 
 
 
127 aa  134  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  51.2 
 
 
129 aa  134  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 
126 aa  134  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  51.2 
 
 
129 aa  134  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  51.2 
 
 
129 aa  134  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  51.2 
 
 
129 aa  134  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 
128 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 
140 aa  133  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
126 aa  133  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
132 aa  133  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 
125 aa  133  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 
126 aa  131  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 
124 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 
124 aa  130  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  50.82 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 
128 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 
124 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 
126 aa  127  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  49.19 
 
 
135 aa  127  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0543  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  50.83 
 
 
126 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 
125 aa  124  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  47.24 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  49.59 
 
 
128 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 
124 aa  124  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 
124 aa  123  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 
124 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  52.14 
 
 
120 aa  123  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  49.18 
 
 
148 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 
126 aa  122  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  50.42 
 
 
124 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  51.28 
 
 
120 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  50.81 
 
 
127 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 
125 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  48.78 
 
 
133 aa  121  3e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  45.53 
 
 
127 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
124 aa  121  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  48.74 
 
 
129 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 
128 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>