More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9383 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  100 
 
 		 324 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  68.04 
 
 		 323 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  64.89 
 
 		 312 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  60.42 
 
 		 333 aa  350  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  68.18 
 
 		 309 aa  345  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  57.7 
 
 		 328 aa  338  9e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  59.81 
 
 		 331 aa  331  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  57.96 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  57.88 
 
 		 321 aa  328  6e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  62.09 
 
 		 295 aa  326  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  65.06 
 
 		 392 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  59.11 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  57.32 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  55.79 
 
 		 344 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  56.48 
 
 		 335 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  61.85 
 
 		 529 aa  314  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  63.43 
 
 		 383 aa  309  4e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  56.33 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  56.33 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  56.33 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  60.29 
 
 		 472 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  54.27 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  54.15 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  50.54 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  58.33 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  50.44 
 
 		 341 aa  295  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  61.42 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  49.71 
 
 		 358 aa  288  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  54.07 
 
 		 347 aa  288  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  56.25 
 
 		 377 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  55.81 
 
 		 367 aa  282  7.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  58.51 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  57.94 
 
 		 268 aa  268  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  58.82 
 
 		 438 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  58.82 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  56.51 
 
 		 624 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  47.3 
 
 		 424 aa  257  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  47.64 
 
 		 450 aa  240  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  47.39 
 
 		 286 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  42.22 
 
 		 295 aa  215  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  45.89 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  41.56 
 
 		 295 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  42.36 
 
 		 307 aa  209  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  38.83 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  42.34 
 
 		 289 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  43.06 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  38.11 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  38.11 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  42.43 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  43.45 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  43.45 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  43.45 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.83 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  44.31 
 
 		 272 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  44.88 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  43.13 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  41.04 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  43.65 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  39.23 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  43.89 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  43.65 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  43.89 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  43.89 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  43.89 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  43.89 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  43.89 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  44.27 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  43.89 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  41.54 
 
 		 282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  44.55 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  45.28 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  41.8 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  43.23 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  43.94 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  37.03 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  44.09 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  36.36 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  40.45 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  43.68 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  37.17 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  43.28 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  44.36 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  44.36 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  43.08 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  40.29 
 
 		 305 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  42.31 
 
 		 298 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  42.31 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  41.61 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  43.12 
 
 		 288 aa  195  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  37.17 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  40.43 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  52.38 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  40.23 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  41.79 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  39.61 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  43.92 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  45.15 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  39.68 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  39.68 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  39.68 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>