170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5454 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  100 
 
 		 215 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  48.04 
 
 		 187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  44.13 
 
 		 191 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  47.49 
 
 		 187 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  43.23 
 
 		 191 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  43.58 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  61.08 
 
 		 204 aa  131  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  44.62 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  44.21 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  43.89 
 
 		 189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  45.81 
 
 		 184 aa  124  9e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  50.86 
 
 		 180 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  46.63 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  45.81 
 
 		 187 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  44.69 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  45.25 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  45.25 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  44.69 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  44.69 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  44.69 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  46.45 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  49.68 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  40.66 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  43.02 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  53.42 
 
 		 179 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  46.15 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  39.61 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  46.15 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  46.15 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  45.54 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  40.61 
 
 		 184 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  40.61 
 
 		 184 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  42.86 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  46.06 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  45.25 
 
 		 187 aa  99.4  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  36.53 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  50.57 
 
 		 182 aa  99  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  38.79 
 
 		 182 aa  98.6  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  38.38 
 
 		 197 aa  98.6  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  46.38 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  39.31 
 
 		 179 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  49.69 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  39.25 
 
 		 216 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  45.56 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  36.57 
 
 		 184 aa  88.6  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1333  BioY protein  57.66 
 
 		 144 aa  85.1  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.692637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  35.89 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  42.48 
 
 		 225 aa  84.7  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  35.43 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  38.2 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  44.06 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  38.57 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  34.62 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  41.44 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  37.13 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  41.4 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  48.84 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0845  BioY protein  48.84 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  41.38 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  37.95 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2005  BioY protein  54.17 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  46.96 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  37.7 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  36.59 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  35.67 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  32.2 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  33.33 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  36.88 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  45.06 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  38.62 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  40.46 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  42 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  39.33 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  38.65 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  30.67 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  40.77 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  40 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  35.19 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  44.74 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  34.19 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  37.5 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  37.91 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  36.31 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  39.66 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  39 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  38.97 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  39.58 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  34.36 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  36.24 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  33.33 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  29.78 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  29.78 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  29.78 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  32.11 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  29.78 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  29.78 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  33.99 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  37.32 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  32.62 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  29.61 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>