152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2668 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  100 
 
 
89 aa  187  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  73.81 
 
 
104 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  53.09 
 
 
82 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  60.27 
 
 
115 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  53.85 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  42.25 
 
 
76 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  45.71 
 
 
76 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  45.71 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  32.43 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  50 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  31.08 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  31.08 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3119  putative aminotransferase  45 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.711998  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  40 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  38.57 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  31.08 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  37.29 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  37.29 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  37.29 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  35.71 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.16 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  37.5 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  43.64 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 
81 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  38.18 
 
 
78 aa  54.7  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  33.8 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  39.29 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  34.72 
 
 
77 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  37.29 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  37.29 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  36.36 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  36.36 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  36.36 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  36.36 
 
 
81 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  33.78 
 
 
81 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  35.29 
 
 
77 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  34.25 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  34.25 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  34.25 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  38.89 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  36.36 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  35.59 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  37.7 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  34.48 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  28.99 
 
 
76 aa  50.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  37.5 
 
 
82 aa  50.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  36.21 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  36.21 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  36.21 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  36.21 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  36.21 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  35.71 
 
 
79 aa  50.4  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  36.36 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  35.71 
 
 
81 aa  50.8  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  35.59 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  37.5 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  39.68 
 
 
560 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  35.71 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  37.5 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  35.71 
 
 
81 aa  50.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  36.11 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  36.11 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  34.78 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  35.09 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  33.93 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  33.9 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  34.33 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  32.81 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  32.81 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  34 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3143  SirA family protein  41.89 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  32.81 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1799  SirA family protein  48.48 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  32.81 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  30.99 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  33.93 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  26.76 
 
 
77 aa  47  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  38 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  36 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  38 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  35.19 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  31.15 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  34.29 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.46 
 
 
817 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>