More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1103 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  100 
 
 
210 aa  404  1e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  92.81 
 
 
210 aa  307  9e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  86.87 
 
 
200 aa  305  4e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  82.83 
 
 
200 aa  303  8e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  87.79 
 
 
205 aa  294  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  84.97 
 
 
202 aa  292  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  85.06 
 
 
202 aa  291  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  85.38 
 
 
205 aa  286  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  81.14 
 
 
223 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  81.14 
 
 
223 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  81.14 
 
 
223 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  6.81641e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  81.61 
 
 
222 aa  277  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  3.82419e-06  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  73.74 
 
 
199 aa  276  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  82.08 
 
 
220 aa  276  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.27793e-05  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  83.03 
 
 
215 aa  271  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  5.41133e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  84.38 
 
 
225 aa  268  6e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  6.96393e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  82.42 
 
 
215 aa  265  3e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  81.6 
 
 
236 aa  265  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  81.76 
 
 
208 aa  264  6e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4298  30S ribosomal protein S5  80.22 
 
 
204 aa  263  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  80.98 
 
 
238 aa  263  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3906  30S ribosomal protein S5  80.22 
 
 
204 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497899  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4490  ribosomal protein S5  86.67 
 
 
204 aa  262  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0705  ribosomal protein S5  83.93 
 
 
218 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2642  ribosomal protein S5  84.43 
 
 
214 aa  256  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0644  ribosomal protein S5  83.43 
 
 
218 aa  256  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.883982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3126  ribosomal protein S5  82.56 
 
 
226 aa  255  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6597  30S ribosomal protein S5  84.71 
 
 
201 aa  255  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29570  SSU ribosomal protein S5P  84.57 
 
 
223 aa  251  4e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.219662  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0604  ribosomal protein S5  78.21 
 
 
218 aa  251  5e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.221884  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1140  ribosomal protein S5  84.76 
 
 
210 aa  250  8e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.5558  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04150  30S ribosomal protein S5  83.53 
 
 
209 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0948  ribosomal protein S5  87.74 
 
 
212 aa  247  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.10743  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20700  SSU ribosomal protein S5P  82.91 
 
 
232 aa  238  3e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.950879  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23630  SSU ribosomal protein S5P  81.37 
 
 
227 aa  239  3e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  68.6 
 
 
243 aa  237  9e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  67.24 
 
 
233 aa  233  1e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17000  SSU ribosomal protein S5P  72.32 
 
 
249 aa  231  6e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  4.50138e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  67.52 
 
 
197 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  66.45 
 
 
166 aa  196  2e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  64.1 
 
 
164 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  64.47 
 
 
166 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.49284e-05  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  64.29 
 
 
182 aa  192  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  64 
 
 
166 aa  192  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  64 
 
 
166 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  63.4 
 
 
179 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  6.6757e-06 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  64 
 
 
166 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  62.82 
 
 
166 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  64.29 
 
 
166 aa  189  3e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  57.4 
 
 
183 aa  189  3e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  60.78 
 
 
173 aa  188  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  1.46915e-05 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  64.52 
 
 
167 aa  188  6e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 
166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 
166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.26666e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 
166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 
166 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.3601e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 
166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.95354e-09  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 
166 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 
166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.28927e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  60.26 
 
 
166 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 
166 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.20585e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 
166 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  62.5 
 
 
166 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.348e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  62.18 
 
 
166 aa  185  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 
166 aa  184  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  59.48 
 
 
175 aa  184  8e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
168 aa  182  2e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.59388e-08  unclonable  8.56318e-06 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  61.84 
 
 
166 aa  183  2e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 
167 aa  183  2e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.20088e-08  unclonable  6.04487e-11 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 
168 aa  182  4e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.23427e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 
167 aa  181  5e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.90298e-05  decreased coverage  5.58993e-05 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  60.53 
 
 
168 aa  181  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 
168 aa  181  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.49797e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 
167 aa  181  8e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  3.0102e-12 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 
167 aa  181  8e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.21956e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 
167 aa  181  8e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 
167 aa  181  8e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.5229e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
167 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 
168 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  9.08127e-09 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
167 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  1.54128e-11 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
167 aa  180  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
167 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81151e-09  hitchhiker  1.27878e-09 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 
167 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.55795e-09  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 
167 aa  179  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  8.20766e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 
167 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  3.91785e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  61.84 
 
 
162 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 
167 aa  179  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.426e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 
167 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.33492e-05  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  56.13 
 
 
167 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.77438e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  62.5 
 
 
166 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  57.24 
 
 
167 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  7.86846e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  62.5 
 
 
168 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  55.92 
 
 
166 aa  178  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001725  SSU ribosomal protein S5p (S2e)  55.56 
 
 
167 aa  178  5e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.99413e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  61.84 
 
 
166 aa  177  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  61.84 
 
 
162 aa  177  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.75279e-06  hitchhiker  1.14757e-07 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  60.39 
 
 
173 aa  177  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00747  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 
167 aa  177  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 
167 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.13723e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 
167 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>