64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2269 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  100 
 
 
235 aa  477  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4395  lipolytic protein G-D-S-L family  27.56 
 
 
213 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.750338  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  32.99 
 
 
261 aa  85.1  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  29.36 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
252 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.78 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  32.4 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  32.08 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  30.86 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  30.2 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  26.56 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.63 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  30.63 
 
 
372 aa  65.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  30.56 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  26.88 
 
 
255 aa  61.6  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4982  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.93 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107469 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  33.1 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2847  GDSL family lipase  28.26 
 
 
230 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0175808  normal  0.606951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1762  lipolytic protein G-D-S-L family  25.75 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  27.96 
 
 
194 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1252  lipolytic protein G-D-S-L family  25.81 
 
 
197 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  28.02 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  25.54 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  23.5 
 
 
189 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1053  GDSL family lipase  25.77 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  27.36 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.68 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.98 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  27 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  32.03 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.88 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  27.92 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  28.21 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  26.41 
 
 
230 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  27.43 
 
 
424 aa  48.9  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  27.72 
 
 
1072 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  28.21 
 
 
216 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  27.5 
 
 
648 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1343  lysophospholipase L1 or related esterase  26.51 
 
 
171 aa  48.5  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000279155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  26.98 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  29.61 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  27.21 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  24.23 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  22.8 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  31.11 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2498  putative acyl-CoA thioesterase  28.82 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  24.29 
 
 
206 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  25.62 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  29.93 
 
 
257 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  26.28 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  31.85 
 
 
213 aa  45.1  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  27.08 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  24.02 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  26.76 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.29 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  29.71 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  25.27 
 
 
479 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.91 
 
 
183 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  25.16 
 
 
279 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  26.81 
 
 
322 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  28.33 
 
 
197 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  29.87 
 
 
218 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  27.59 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  22.86 
 
 
221 aa  42.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>