137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1588 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
374 aa  761    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  27.89 
 
 
420 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
406 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2938  hypothetical protein  27.21 
 
 
438 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00302629  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
435 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
468 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  21.3 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  24.23 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  21.64 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  40.22 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  23.48 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
535 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  21.43 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  34.29 
 
 
1119 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
1156 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  26.63 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
429 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  23.22 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
410 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  22.02 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  24.36 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  25.32 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  25.44 
 
 
420 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  34.21 
 
 
394 aa  67  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
703 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  24.19 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
956 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 
422 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  24.81 
 
 
423 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  25.3 
 
 
443 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
443 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
411 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
1340 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  27.22 
 
 
442 aa  63.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 
392 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
414 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  19.81 
 
 
406 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  19.92 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  22.37 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 
436 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  27.16 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  22.78 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  27.78 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  29 
 
 
402 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  24.17 
 
 
410 aa  60.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
419 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  21.8 
 
 
413 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  21.48 
 
 
413 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
407 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 
389 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  21.73 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  28 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  23.62 
 
 
414 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3256  hypothetical protein  32.65 
 
 
1199 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2103  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
405 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2865  hypothetical protein  32.65 
 
 
1199 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.739863  decreased coverage  0.00031468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  21.21 
 
 
405 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  22.44 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  21.43 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  20.95 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  18.03 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  21.14 
 
 
499 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  20.09 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  22.57 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
399 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
399 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0314  hypothetical protein  26.95 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  21.57 
 
 
401 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
994 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.05 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  29.09 
 
 
860 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>