More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1262 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  84.58 
 
 		 427 aa  773    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  84.58 
 
 		 427 aa  773    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  74.47 
 
 		 428 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  71.87 
 
 		 429 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  77.12 
 
 		 431 aa  699    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1262  type II citrate synthase  100 
 
 		 430 aa  901    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.728692  normal  0.31118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  75.71 
 
 		 428 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  71.63 
 
 		 429 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  75.06 
 
 		 428 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0854  type II citrate synthase  85.28 
 
 		 427 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  71.16 
 
 		 429 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  69.58 
 
 		 425 aa  639    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  84.58 
 
 		 427 aa  773    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  83.49 
 
 		 428 aa  771    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  74.25 
 
 		 430 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  73.58 
 
 		 428 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  72.1 
 
 		 429 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  76 
 
 		 429 aa  693    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  69.5 
 
 		 427 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0887  type II citrate synthase  85.28 
 
 		 427 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.304459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  90.89 
 
 		 426 aa  817    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  84.58 
 
 		 427 aa  773    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  84.58 
 
 		 427 aa  773    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0764  type II citrate synthase  85.28 
 
 		 427 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  69.63 
 
 		 427 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0790  type II citrate synthase  85.28 
 
 		 427 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148883  normal  0.115118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  71.87 
 
 		 429 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  84.85 
 
 		 427 aa  779    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  84.58 
 
 		 427 aa  773    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  69.48 
 
 		 454 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  84.58 
 
 		 427 aa  773    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  67.69 
 
 		 430 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  71.63 
 
 		 429 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3105  type II citrate synthase  86.48 
 
 		 428 aa  787    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  72.96 
 
 		 445 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  77.41 
 
 		 429 aa  704    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  84.62 
 
 		 427 aa  773    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  75.06 
 
 		 428 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  76.71 
 
 		 429 aa  699    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  69.88 
 
 		 428 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1794  citrate synthase I  69.41 
 
 		 426 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000880013  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  71.87 
 
 		 429 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0960  citrate synthase  71.36 
 
 		 427 aa  644    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  75.52 
 
 		 428 aa  658    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  75.52 
 
 		 428 aa  658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  73.43 
 
 		 429 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  73.71 
 
 		 428 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  69.88 
 
 		 428 aa  646    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  90.89 
 
 		 426 aa  817    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  90.89 
 
 		 426 aa  817    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  75.52 
 
 		 428 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0825  type II citrate synthase  85.28 
 
 		 427 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  85.35 
 
 		 428 aa  781    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  86.71 
 
 		 428 aa  790    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  69.88 
 
 		 436 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  76.76 
 
 		 428 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  75.06 
 
 		 428 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  84.58 
 
 		 427 aa  773    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  73.68 
 
 		 431 aa  658    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  75.24 
 
 		 428 aa  651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  75.06 
 
 		 428 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  68.94 
 
 		 429 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  68.71 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  68.81 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  68.4 
 
 		 428 aa  623  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  67.37 
 
 		 436 aa  621  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  65.19 
 
 		 428 aa  621  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  67.14 
 
 		 424 aa  624  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  67.52 
 
 		 438 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  66.82 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  66.59 
 
 		 433 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  68.16 
 
 		 431 aa  617  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  67.36 
 
 		 435 aa  615  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  67.36 
 
 		 430 aa  615  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  66.82 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  66.82 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  66.82 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  66.82 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  66.82 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  66.59 
 
 		 433 aa  614  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  67.3 
 
 		 430 aa  615  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  67.76 
 
 		 429 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  66.35 
 
 		 433 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  66.82 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  66.82 
 
 		 433 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  66.2 
 
 		 433 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  66.35 
 
 		 433 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  67.29 
 
 		 429 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  67.06 
 
 		 428 aa  612  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  67.62 
 
 		 429 aa  607  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  65.65 
 
 		 433 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  66.59 
 
 		 432 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  66.19 
 
 		 434 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  67.21 
 
 		 430 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  65.65 
 
 		 433 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  65.65 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  65.65 
 
 		 433 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  66.67 
 
 		 430 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  65.41 
 
 		 433 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  65.65 
 
 		 433 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>