More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0836 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  65.51 
 
 		 460 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  65.51 
 
 		 460 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  64.64 
 
 		 460 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  100 
 
 		 461 aa  963    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  65.29 
 
 		 460 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  64.86 
 
 		 460 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  65.22 
 
 		 470 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  63.12 
 
 		 462 aa  625  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  62.88 
 
 		 465 aa  621  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  62.66 
 
 		 470 aa  623  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  59.78 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  54.9 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  54.59 
 
 		 459 aa  547  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  54.33 
 
 		 459 aa  541  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  53.9 
 
 		 459 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  54.55 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  52.83 
 
 		 470 aa  525  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  51.84 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  53.83 
 
 		 457 aa  523  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  47.73 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  47.96 
 
 		 475 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.47 
 
 		 479 aa  450  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  41.47 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  41.76 
 
 		 452 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  40.76 
 
 		 475 aa  349  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  40.4 
 
 		 478 aa  345  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  40.89 
 
 		 478 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  41.39 
 
 		 478 aa  343  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  37.69 
 
 		 467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  37.04 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  36.88 
 
 		 450 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  37.55 
 
 		 465 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  36.77 
 
 		 451 aa  299  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  36.94 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  36.38 
 
 		 469 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  37.02 
 
 		 468 aa  296  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  34.06 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  35.08 
 
 		 446 aa  294  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  34.86 
 
 		 446 aa  291  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  36.24 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  37.23 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  36.09 
 
 		 453 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  34.35 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  35.38 
 
 		 458 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  35.34 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  35.46 
 
 		 457 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  31.62 
 
 		 474 aa  279  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  36.27 
 
 		 478 aa  278  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  34.69 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  36.18 
 
 		 470 aa  274  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  34.84 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  36.09 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  35.46 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  33.26 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  35.68 
 
 		 468 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  35.24 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  34.08 
 
 		 467 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  35.61 
 
 		 475 aa  270  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  35.97 
 
 		 478 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  36.27 
 
 		 475 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  34.14 
 
 		 488 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  32.91 
 
 		 475 aa  266  7e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  34.25 
 
 		 476 aa  266  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  33.47 
 
 		 478 aa  265  8.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  34.41 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  33.55 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  34.21 
 
 		 439 aa  264  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  35.7 
 
 		 447 aa  264  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  32.77 
 
 		 484 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  34.9 
 
 		 448 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  34.79 
 
 		 470 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  32.53 
 
 		 455 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  34.79 
 
 		 470 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  32.08 
 
 		 487 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  32.47 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  34.05 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  33.68 
 
 		 472 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  34.39 
 
 		 478 aa  261  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  33.76 
 
 		 448 aa  260  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  32.22 
 
 		 458 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  33.83 
 
 		 479 aa  259  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  33.54 
 
 		 478 aa  259  8e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  34.55 
 
 		 465 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  33.48 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  34.38 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl313  beta-glucosidase/alpha xylosidase  33.26 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  35.67 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  35.05 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  34.7 
 
 		 482 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  32.92 
 
 		 491 aa  253  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  33.98 
 
 		 461 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  35.03 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  32.69 
 
 		 474 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  33.7 
 
 		 452 aa  253  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  31.97 
 
 		 472 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  33.63 
 
 		 489 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  32.62 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  33.33 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  34.39 
 
 		 470 aa  251  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>