More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0051 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0051  nucleotidyl transferase  100 
 
 
351 aa  723  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0167  nucleotidyl transferase  76.35 
 
 
352 aa  553  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0256  nucleotidyl transferase  76.35 
 
 
352 aa  553  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00676  mannose-1-phosphate guanyltransferase  72.08 
 
 
352 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001798  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  70.94 
 
 
352 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  64.39 
 
 
352 aa  475  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  61.82 
 
 
352 aa  467  1e-130  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  60.11 
 
 
352 aa  460  1e-128  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  57.88 
 
 
350 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  57.88 
 
 
350 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  52 
 
 
353 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  49.71 
 
 
351 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  51.17 
 
 
361 aa  346  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  47.06 
 
 
348 aa  338  7e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  46.84 
 
 
351 aa  335  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  45.88 
 
 
348 aa  332  7e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  43.82 
 
 
346 aa  307  1e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  41.62 
 
 
360 aa  295  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  41.23 
 
 
367 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  1.96984e-05 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  44.3 
 
 
320 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  40.06 
 
 
355 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  38.6 
 
 
352 aa  265  9e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  37.61 
 
 
476 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  39.71 
 
 
353 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  39.42 
 
 
351 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  36.5 
 
 
345 aa  253  5e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  2.08573e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  37.2 
 
 
356 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  35.22 
 
 
341 aa  246  5e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  35.52 
 
 
341 aa  244  1e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  37.43 
 
 
354 aa  216  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  39.73 
 
 
238 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  39.21 
 
 
238 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2643  nucleotidyl transferase  31.58 
 
 
348 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  36.8 
 
 
833 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  38.89 
 
 
818 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
854 aa  153  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  36 
 
 
229 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  35.44 
 
 
833 aa  149  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 
834 aa  149  1e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  35.5 
 
 
843 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  34.17 
 
 
348 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  35.32 
 
 
832 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  35.22 
 
 
820 aa  147  4e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
841 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  36.09 
 
 
828 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  35.93 
 
 
820 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  37.44 
 
 
238 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  36.75 
 
 
835 aa  140  4e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  36.44 
 
 
237 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  33.91 
 
 
827 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  36.02 
 
 
818 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.04 
 
 
828 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  35.06 
 
 
830 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  33.48 
 
 
784 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  33.48 
 
 
784 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
785 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  33.9 
 
 
843 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
827 aa  136  6e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.02 
 
 
349 aa  135  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  33.05 
 
 
784 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  33.05 
 
 
784 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.05 
 
 
784 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  33.05 
 
 
784 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.05 
 
 
784 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  36.8 
 
 
359 aa  134  2e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0481  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
267 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
816 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  34.62 
 
 
828 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  35.04 
 
 
842 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  33.05 
 
 
784 aa  133  4e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  33.05 
 
 
784 aa  133  4e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  35.29 
 
 
364 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  34.76 
 
 
243 aa  131  1e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  35.32 
 
 
359 aa  131  2e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  34.58 
 
 
359 aa  131  2e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
359 aa  131  2e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  34.32 
 
 
357 aa  131  2e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
359 aa  131  2e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
359 aa  131  2e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  32.91 
 
 
784 aa  131  2e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  32.47 
 
 
828 aa  130  2e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  35.22 
 
 
832 aa  131  2e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 
821 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
810 aa  129  5e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  34.32 
 
 
366 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
712 aa  129  7e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  34.47 
 
 
359 aa  129  8e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  33.47 
 
 
842 aa  129  9e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
238 aa  128  1e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
830 aa  128  1e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  34.78 
 
 
832 aa  128  1e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  34.51 
 
 
238 aa  129  1e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  36.44 
 
 
351 aa  127  2e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.33 
 
 
837 aa  127  2e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  34.35 
 
 
370 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  34.32 
 
 
357 aa  127  4e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  32.17 
 
 
835 aa  127  4e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 
370 aa  127  4e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
835 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  32.33 
 
 
347 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>