32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0351 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0351  integrase family protein  100 
 
 		 467 aa  961    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0169831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0559  phage integrase family protein  43.63 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0691  hypothetical protein  43.2 
 
 		 454 aa  325  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0078  integrase family protein  42.67 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0565  phage integrase family protein  40.22 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0148  hypothetical protein  42.89 
 
 		 456 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  42.62 
 
 		 433 aa  306  6e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8660  hypothetical protein  42 
 
 		 454 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  39.82 
 
 		 492 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4454  integrase family protein  40.76 
 
 		 477 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0976  hypothetical protein  36.74 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4373  integrase family protein  57.07 
 
 		 226 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0598  integrase family protein  48.7 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0505  hypothetical protein  54.13 
 
 		 114 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4456  hypothetical protein  57.14 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0897  hypothetical protein  54.41 
 
 		 89 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2186  hypothetical protein  44.83 
 
 		 104 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551009  normal  0.195431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2961  putative integrase  55.93 
 
 		 66 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435315  normal  0.790105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.32 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  23.88 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  35.29 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  24.76 
 
 		 469 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  27.37 
 
 		 354 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.04 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  38.71 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.17 
 
 		 397 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  22.88 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  37.7 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  22.53 
 
 		 370 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  27.19 
 
 		 268 aa  43.9  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  25.42 
 
 		 396 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  27.49 
 
 		 409 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>