More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3451 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 140 aa  286  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  84.67 
 
 		 139 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  83.94 
 
 		 139 aa  241  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  87.5 
 
 		 138 aa  231  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  68.42 
 
 		 136 aa  200  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  68.66 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  68.66 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  66.18 
 
 		 145 aa  191  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  62.79 
 
 		 164 aa  183  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  62.79 
 
 		 164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  63.28 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  62.69 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  61.11 
 
 		 171 aa  176  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  63.41 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  65.22 
 
 		 208 aa  168  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  59.2 
 
 		 164 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  57.48 
 
 		 165 aa  161  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  61.72 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  61.72 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  59.68 
 
 		 137 aa  160  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  58.27 
 
 		 149 aa  159  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  58.27 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  57.48 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  54.01 
 
 		 168 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  56.69 
 
 		 162 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  54.4 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  54.03 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  53.19 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 152 aa  143  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 195 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  51.45 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  53.54 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  53.6 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  50.79 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  53.17 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  50.4 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  47.79 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  47.79 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  55 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  50.4 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  48.21 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  41.6 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  42.97 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  42.97 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  38.52 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  35.83 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  30.21 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  31.15 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  28.93 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  34.04 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  37.11 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  31.54 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  30.33 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  31.86 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  35.63 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  30.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  32.22 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  33.71 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  30.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  30.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  33.02 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  32.99 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  32.18 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  30.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  30.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  32.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  32.04 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  32.04 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1727  ferric uptake regulator, Fur family  35.23 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  36.96 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  32.53 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  33.72 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  34.78 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  31.33 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  30.59 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  30.59 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  30.59 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  38.2 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  31.82 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  30.59 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  35 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  30.84 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  33.65 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  35 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  33.72 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  30.59 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  30.59 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  30.59 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>