More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3937 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  300  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  92.47 
 
 
146 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  92.47 
 
 
146 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  68.84 
 
 
138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  65 
 
 
174 aa  193  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  61.31 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  51.94 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  50.39 
 
 
163 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  55.2 
 
 
137 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  53.17 
 
 
140 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  54.47 
 
 
143 aa  133  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  48.84 
 
 
165 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 
165 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  49.61 
 
 
168 aa  130  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  48.84 
 
 
162 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 
164 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  52.42 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  49.62 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  52.24 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  48.46 
 
 
147 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  48.46 
 
 
147 aa  128  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  51.49 
 
 
139 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  49.21 
 
 
171 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  48.8 
 
 
166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  48 
 
 
164 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  48 
 
 
164 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  46.92 
 
 
145 aa  124  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  53.12 
 
 
143 aa  122  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  46.4 
 
 
158 aa  120  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  48.76 
 
 
136 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  54.78 
 
 
208 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  44.96 
 
 
164 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  44.44 
 
 
158 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  48 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  48 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  41.18 
 
 
139 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  44.62 
 
 
147 aa  108  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  41.13 
 
 
145 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  42.47 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  38.93 
 
 
161 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  38.17 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  38.58 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  33.87 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  34.45 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  33 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  39.18 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  32.26 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  30.33 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  34.51 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  34.51 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  34.51 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  34.51 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  34.51 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  31 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  31.3 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  35.19 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  35.19 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.23 
 
 
150 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  34.23 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  31.65 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  33.91 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  33.67 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  34.44 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  30.43 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  31.4 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  27.42 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  34.51 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  35.11 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  34.34 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  29.32 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  35.96 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  27.48 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  26.61 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  34.02 
 
 
139 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  28.16 
 
 
142 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  32.63 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0486  ferric uptake regulator, Fur family  29.17 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.53591  normal  0.162007 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  33.71 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  33.71 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  33.71 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  33.71 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  29.23 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  31.63 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.706026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>