More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0364 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  99.34 
 
 
195 aa  312  9e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  51.56 
 
 
162 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  51.56 
 
 
162 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  50.72 
 
 
143 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  50.78 
 
 
165 aa  147  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  50.37 
 
 
163 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 
139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 
139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  52.34 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  46.15 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 
149 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  46.15 
 
 
164 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  52.46 
 
 
140 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  45.59 
 
 
166 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  50 
 
 
138 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  51.59 
 
 
136 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  49.22 
 
 
165 aa  140  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  49.22 
 
 
168 aa  140  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  44.53 
 
 
171 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  51.3 
 
 
208 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  50.82 
 
 
137 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  48.87 
 
 
147 aa  133  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  45.83 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  49.22 
 
 
174 aa  128  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  46.32 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  46.46 
 
 
147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  46.46 
 
 
147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  46.46 
 
 
145 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  45.59 
 
 
166 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  48 
 
 
138 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  45.59 
 
 
166 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  42.03 
 
 
158 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  44.27 
 
 
164 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  47.29 
 
 
147 aa  120  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  44.96 
 
 
164 aa  116  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  39.73 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  43.85 
 
 
143 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  44 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  44 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  49.12 
 
 
161 aa  113  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  41.61 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  31.2 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  34.51 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  36.07 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  30.65 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  34.86 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  35.34 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  36.17 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  35.29 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1672  FUR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  34.69 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  34.69 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  35.87 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  34 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  33 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  33.98 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  34 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0492  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  36.94 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000219354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  31.37 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  32.04 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  29.77 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  33.68 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  34.02 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  31.07 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  34 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  31.07 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  30.77 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  30.33 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  28.03 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  28.03 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  31.07 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  33.68 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  32.65 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  32.65 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  34.02 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  36.63 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  30.17 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  33.05 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  35.11 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  33.67 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0486  ferric uptake regulator, Fur family  31.09 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.53591  normal  0.162007 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  31.63 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>