More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3788 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 137 aa  279  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  60.74 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  59.68 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  54.62 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  53.08 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  53.08 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  53.08 
 
 		 171 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  58.54 
 
 		 139 aa  151  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  62.71 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  58.54 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  55.47 
 
 		 138 aa  150  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  53.08 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  58.54 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  55.38 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 		 162 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  52.31 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  53.08 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  53.08 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  56.49 
 
 		 163 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  52.31 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  53.68 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  52.9 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  53.85 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  52.76 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  53.85 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  52.76 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  51.97 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  54.47 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  55.2 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  55.2 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  54.03 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  55.28 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  55.2 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 195 aa  134  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  52.03 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  50.4 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  52.31 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  50 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  46.09 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  45.9 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  55.32 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  40.65 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  44.44 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  44.44 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  40.16 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  40.16 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  39.17 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  37.27 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  30.4 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  30.77 
 
 		 169 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  34.55 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  36.89 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  34.55 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  37.62 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  31.4 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  31.4 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  30.83 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  33.87 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  33.87 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  33.87 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  30 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  30 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  33.87 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  30 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  30 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  31.9 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  31.4 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  31.4 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  31.4 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  36.27 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  29.17 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  31.09 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  33.94 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  30 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  30.58 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  33.61 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  31.9 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  33.61 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  33.61 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  34.19 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  34.19 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  34.19 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  34.19 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  34.19 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  31.9 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>