More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0071 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 165 aa  344  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  82.82 
 
 		 168 aa  284  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  90.91 
 
 		 165 aa  281  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  77.44 
 
 		 162 aa  266  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  77.44 
 
 		 162 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  86.76 
 
 		 164 aa  255  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  82.52 
 
 		 149 aa  253  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  64.23 
 
 		 171 aa  197  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  60.69 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  54.72 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  57.24 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  67.48 
 
 		 208 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  64.57 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  58.55 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  58.55 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  62.7 
 
 		 139 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  61.9 
 
 		 139 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  57.69 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  57.48 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  56.82 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  56.82 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  55.3 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  56.39 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  56.92 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  57.04 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  55.38 
 
 		 137 aa  147  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  51.61 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  48.57 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  48.87 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  51.91 
 
 		 142 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  55.56 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  50.78 
 
 		 138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  53.49 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  48.84 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  51.49 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  50 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  43.24 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  47.79 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  39.57 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  40.94 
 
 		 131 aa  95.1  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 		 139 aa  94.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  37.3 
 
 		 136 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  31.39 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  36.13 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  34.78 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  36.45 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  31.2 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  35.94 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  36 
 
 		 140 aa  62  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  32.32 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  31.54 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  40.4 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  36.67 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  29.77 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  32.04 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  27.56 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  40.74 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  40.74 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0492  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  37.89 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000219354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  30.47 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  33.02 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  29.77 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  38.1 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  29.77 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  32.77 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  37.04 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  34.34 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  28.21 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  35.56 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  34.88 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  29.36 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  36.67 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>