More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0614 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 162 aa  338  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  96.91 
 
 		 162 aa  329  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  88.59 
 
 		 149 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  77.44 
 
 		 165 aa  266  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  80.54 
 
 		 168 aa  258  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  83.22 
 
 		 165 aa  258  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  86.03 
 
 		 164 aa  249  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  63.43 
 
 		 171 aa  191  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  61.76 
 
 		 166 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  67.48 
 
 		 208 aa  187  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  60.29 
 
 		 164 aa  187  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  59.85 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  65.62 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  60 
 
 		 166 aa  173  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  60 
 
 		 166 aa  173  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  62.4 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  61.6 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  58.02 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  58.27 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  56.39 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  56.39 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  56.39 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  53.96 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  56.15 
 
 		 143 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  54.96 
 
 		 136 aa  153  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 195 aa  147  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  51.61 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  50.74 
 
 		 164 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  56.82 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  55.12 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  57.14 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  48.87 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  47.52 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  49.22 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  50 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  49.56 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  35.38 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  37.86 
 
 		 141 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  39.06 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  34.65 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  30.43 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  35.83 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  36.89 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  35.42 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  37.37 
 
 		 134 aa  62  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  28.46 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  32.06 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  29.6 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  33.66 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  31.3 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  33.33 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  31.3 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0492  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  40.62 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000219354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  30.53 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  28.24 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0486  ferric uptake regulator, Fur family  31.36 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.53591  normal  0.162007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  37.37 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  37.37 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  37.37 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  37.37 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  37.37 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  37.37 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  37.37 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  29.36 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  37.37 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  36.73 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  31.4 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  29.23 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1277  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000971648  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  32.94 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.02 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  30.85 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  30.85 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  28.57 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  29.01 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  28.7 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>