226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1714 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  56.62 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  53.08 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  53.49 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  50.75 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  50 
 
 		 139 aa  136  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  39.16 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  33.79 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  33.79 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  41.73 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  40.16 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  37.6 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  39.52 
 
 		 171 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  37.3 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  36.8 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  34.59 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  36.8 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  35.71 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  35.56 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  36.57 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  36.51 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  35.2 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  35.43 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  36.51 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  34.65 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  37.3 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  36.89 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  38.4 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  38.4 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  34.4 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  33.6 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  39.45 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  34.71 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  36.57 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  36.57 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  37.21 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 195 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  35.07 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1915  ferric uptake regulator family protein  32.73 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.934218  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1195  ferric uptake regulator family protein  37.37 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.4932  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  28.35 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  36.94 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  42.7 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  36.17 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  34.38 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  31.78 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  37.23 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  34 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  32.04 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  34.02 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  30.83 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0486  ferric uptake regulator, Fur family  30.97 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.53591  normal  0.162007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4071  ferric uptake regulator, Fur family  32 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  35.51 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  32.04 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  32.18 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2366  ferric uptake regulator, Fur family  35.29 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.437919 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  33.64 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  33.64 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3240  ferric uptake regulator family protein  32.08 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000230922  hitchhiker  0.00191408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  35.11 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  35.71 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2791  ferric uptake regulator family protein  28.32 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859814  normal  0.190888 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  32.67 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0945  ferric uptake regulator, Fur family  29.29 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0480  ferric uptake regulator, Fur family  32.26 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1409  ferric uptake regulator family protein  28.18 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000310643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  31 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  28.81 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  31.18 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  27.19 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  28 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1277  ferric uptake regulator family protein  29.09 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000971648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  31.91 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  31.91 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  31.91 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  31.91 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  31.91 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  31.91 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  28.93 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  31.91 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>