More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2346 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 164 aa  337  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  60.84 
 
 		 158 aa  177  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  72.17 
 
 		 161 aa  174  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  49.32 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  50.74 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  53.15 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  54.01 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  49.26 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  55.91 
 
 		 138 aa  141  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  47.18 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  47.18 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  48.57 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  51.41 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  54.48 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  56.1 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  56.1 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  53.6 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  48.53 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  51.94 
 
 		 145 aa  134  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  49.3 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  52.38 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  52.38 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  52.89 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  52.89 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  50.39 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  46.88 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  43.75 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  49.22 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  51.75 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  51.75 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  44.16 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 195 aa  117  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  46.09 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  44.96 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  43.41 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  43.41 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  44.85 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  43.41 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  44.09 
 
 		 142 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  41.67 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  34.17 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  34.13 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  37.1 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  34.45 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  32.28 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  30.6 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  29.75 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  32.98 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1672  FUR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  32.69 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  28.91 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  27.48 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  33.83 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  36.73 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  34.45 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  38.95 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  28.93 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  29.69 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  34.74 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  28.48 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  33.68 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0367  FUR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.596718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  29.69 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  35.11 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  38.04 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  38.04 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  38.04 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  38.04 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  38.04 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  38.04 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  33.68 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  36.96 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  38.04 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  38.04 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  38.04 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  38.04 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  38.04 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  38.04 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  38.04 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0344  FUR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.470674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3385  ferric uptake regulator, Fur family  38.04 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.0000888993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0571  ferric uptake regulator family protein  38.04 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  36 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  34.02 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  38.04 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  38.04 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  37.04 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  38.04 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  35.87 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  37.04 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2593  ferric uptake regulator family protein  36.96 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  36.96 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>