280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3691 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 158 aa  322  9e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  55.7 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  59.12 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  58.96 
 
 		 166 aa  167  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  57.46 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  57.04 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  54.35 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  53.96 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  57.45 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  53.68 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  54.81 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  54.81 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  57.46 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  57.46 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  56.06 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  53.12 
 
 		 138 aa  147  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  54.33 
 
 		 139 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  54.33 
 
 		 139 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  55 
 
 		 140 aa  140  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  50.78 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  49.6 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  52.31 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  48.82 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  48.85 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  46.45 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  52.89 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 195 aa  117  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  44.85 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  43.84 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  43.28 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  47.58 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  47.58 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  45.24 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  42.42 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  42.47 
 
 		 146 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  50.94 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  39.84 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  36.07 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  42.02 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  42.02 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  39.83 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  34.17 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  34.48 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2727  ferric uptake regulator family protein  35.34 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  40.96 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  33 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  31.9 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  35.56 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  36.56 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  33 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  31.18 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  30.77 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  29.29 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  33.7 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2494  FUR family manganese uptake regulator  31 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0020  ferric uptake regulator family protein  28.97 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0165645  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  32.5 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1161  ferric uptake regulator family protein  31 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.13561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  29.46 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4731  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  29.46 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  34.57 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  27.78 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0454  ferric uptake regulator, Fur family  28.7 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  34.57 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  30.84 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  30.84 
 
 		 134 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  31.68 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  31.68 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  32.94 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  31.68 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  31.68 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  31.68 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  29 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0984  ferric uptake regulator family protein  35.29 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  31.4 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  31.68 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>