More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3940 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 136 aa  275  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  72.09 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  72.09 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  70.99 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  68.42 
 
 		 140 aa  200  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  71.32 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  71.32 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  64.44 
 
 		 147 aa  189  8e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  69.4 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  61.72 
 
 		 166 aa  168  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  60.94 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  60.94 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 		 171 aa  167  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  60.77 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  66.67 
 
 		 208 aa  160  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  56.92 
 
 		 165 aa  156  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  54.96 
 
 		 162 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  53.44 
 
 		 162 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  54.62 
 
 		 165 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  54.2 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  55.47 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  54.62 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  58.54 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  54.33 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  60.16 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  60.16 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  52.99 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  56 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 195 aa  140  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  53.44 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  48.84 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  52.07 
 
 		 138 aa  131  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  52.89 
 
 		 164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  51.59 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  50.78 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  48.76 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  47.93 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  47.93 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  45.6 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  49.07 
 
 		 161 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  37.9 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  37.8 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  37.3 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  39.68 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  39.68 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  34.71 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01084  ferric uptake regulator  36.26 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00618384  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  34.74 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  37.65 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  37.65 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  37.65 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  34.07 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  36.47 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  34.44 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  34.44 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  37.93 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  37.93 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  34.44 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  37.93 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  36.47 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  35.56 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  34.44 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  32.33 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  36.78 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  36.78 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  36.78 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  32.63 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  32.63 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  35.35 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  36.36 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.351465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>