More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2230 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  96.95 
 
 
164 aa  325  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  88.96 
 
 
166 aa  293  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  82.1 
 
 
171 aa  278  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  87.12 
 
 
166 aa  262  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  87.12 
 
 
166 aa  262  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  61.76 
 
 
149 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  54.72 
 
 
165 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  60.29 
 
 
162 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  60.29 
 
 
162 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  60 
 
 
165 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  60 
 
 
168 aa  185  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  52.47 
 
 
164 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  63.08 
 
 
208 aa  184  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  68.25 
 
 
139 aa  183  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  68.25 
 
 
139 aa  183  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  62.79 
 
 
140 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  63.28 
 
 
138 aa  177  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  62.88 
 
 
147 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  62.88 
 
 
147 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  61.65 
 
 
145 aa  170  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  59.4 
 
 
143 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  60.94 
 
 
136 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  58.65 
 
 
147 aa  166  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  55.7 
 
 
158 aa  164  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  53.08 
 
 
137 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  55.91 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  55.38 
 
 
158 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
195 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
152 aa  144  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  56.92 
 
 
143 aa  144  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  54.76 
 
 
142 aa  143  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  53.15 
 
 
164 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  53.12 
 
 
147 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  51.18 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  48 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  49.6 
 
 
138 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  48 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  46.46 
 
 
146 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  46.46 
 
 
146 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  48.7 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  38.76 
 
 
139 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  36.84 
 
 
145 aa  99  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  36.8 
 
 
136 aa  88.6  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  35.2 
 
 
139 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  39.2 
 
 
131 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  39.2 
 
 
141 aa  85.1  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  37.7 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  41.41 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  41.41 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  39.39 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  32.8 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  34.62 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63020  ferric uptake regulation protein  39 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  35.71 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  39 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  34.26 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5484  ferric uptake regulation protein  39 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  38.24 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  34.75 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  38.14 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  36.08 
 
 
136 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  35.51 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  35.51 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4508  ferric uptake regulation protein  39 
 
 
135 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.358038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  35.51 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  35.51 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  35.51 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  35.51 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  35.51 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  36 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0760  ferric uptake regulator family protein  39 
 
 
134 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809862  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  36.27 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0062  ferric uptake regulator, Fur family  29.13 
 
 
136 aa  62  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4198  ferric-uptake regulator  38 
 
 
135 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  34 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  36.11 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
181 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0702  ferric uptake regulator family protein  38 
 
 
134 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 
149 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  32.99 
 
 
140 aa  61.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  33.87 
 
 
146 aa  61.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  30.77 
 
 
147 aa  60.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  36.36 
 
 
143 aa  60.8  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  34 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4730  ferric uptake regulator, Fur family  32.28 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4596  ferric uptake regulator family protein  32.28 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  34.31 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  37.11 
 
 
140 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>