More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1096 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  78.41 
 
 		 441 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  77.73 
 
 		 441 aa  668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 465 aa  926    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  75.17 
 
 		 444 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  63.76 
 
 		 490 aa  521  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  63.31 
 
 		 472 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  63.76 
 
 		 472 aa  514  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  63.48 
 
 		 460 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  58.73 
 
 		 457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  57.82 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  58.35 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  57.97 
 
 		 474 aa  438  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  57.27 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  56.75 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  58.29 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  56.75 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  56.55 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  55.84 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  58.06 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  56.06 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  55.5 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  59 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  57.31 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  55.68 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  54.53 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  57.71 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  56.4 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  57.71 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  54.39 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  53.58 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  54.04 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  56.52 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  59.4 
 
 		 448 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  52.67 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  50 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  56.94 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  54 
 
 		 436 aa  395  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.61 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.5 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  55.47 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  55.61 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  52.96 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  51.99 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  46.02 
 
 		 414 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  46.02 
 
 		 414 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  46.38 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  45.48 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  44.79 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  47.52 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  44.57 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.76 
 
 		 433 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.5 
 
 		 433 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  44.97 
 
 		 432 aa  293  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.43 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  45.04 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  46.54 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  42.82 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  44.9 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  45.1 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  45.1 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  48.68 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  42.61 
 
 		 444 aa  290  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  42.79 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  46.26 
 
 		 426 aa  289  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  44.63 
 
 		 489 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  44.67 
 
 		 436 aa  286  7e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  44.2 
 
 		 433 aa  286  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  44.63 
 
 		 489 aa  286  8e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  44.62 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.59 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.07 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  43.26 
 
 		 426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  41.35 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  45.98 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  42.61 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  47.49 
 
 		 428 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  42.41 
 
 		 429 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  44.36 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  44.36 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  44.36 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  44.36 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  44.36 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  44.36 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  44.36 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  44.36 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  46.26 
 
 		 433 aa  280  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.97 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  44.8 
 
 		 439 aa  279  9e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  43.26 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  43.26 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  43.26 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  43.26 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  43.52 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  43.26 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  41.29 
 
 		 429 aa  276  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  49.68 
 
 		 450 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  48.09 
 
 		 450 aa  276  6e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  45.3 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  45.84 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>