233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0732 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  100 
 
 
217 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  71.63 
 
 
239 aa  287  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  39.91 
 
 
246 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  38.99 
 
 
246 aa  141  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0724  AzlC family protein  38.53 
 
 
246 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5230  AzlC family protein  38.79 
 
 
244 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0536388  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4160  AzlC family protein  38.32 
 
 
244 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4811  AzlC-like  38.32 
 
 
244 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278512  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3356  AzlC family protein  38.32 
 
 
244 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840273  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3277  AzlC family protein  38.89 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2900  branched-chain amino acid efflux pump AzlC  38.32 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5135  AzlC family protein  38.43 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.948327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  39.39 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  35.51 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  39.49 
 
 
243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  38.38 
 
 
243 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  35.65 
 
 
240 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  37.44 
 
 
241 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  38.36 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  37.91 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  35.9 
 
 
242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  35.38 
 
 
242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  35.9 
 
 
242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  35.9 
 
 
242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  36.06 
 
 
239 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  37.02 
 
 
265 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  37.56 
 
 
250 aa  111  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  37.38 
 
 
238 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  39.34 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  36.65 
 
 
233 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1318  AzlC family protein  36.07 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1824  AzlC-like  34.82 
 
 
246 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  35.02 
 
 
240 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4140  AzlC-like  34.42 
 
 
245 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  35.16 
 
 
246 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  34.29 
 
 
237 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  35.26 
 
 
242 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4739  AzlC-like  37.14 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  35.71 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  35.15 
 
 
242 aa  91.7  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  35.12 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1763  AzlC family protein  36.61 
 
 
236 aa  91.3  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181843  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  35.12 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  35.12 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  35.12 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  35.33 
 
 
307 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  35.12 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  35.12 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  37.8 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  35.38 
 
 
313 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  35.15 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  33.72 
 
 
240 aa  89.4  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  35.65 
 
 
236 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  31.31 
 
 
241 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  37.39 
 
 
231 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  37.39 
 
 
255 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  29.19 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  37.39 
 
 
255 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2877  AzlC family protein  34 
 
 
248 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  34.88 
 
 
258 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.13 
 
 
242 aa  85.5  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  32.3 
 
 
247 aa  85.5  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  36.24 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  36.04 
 
 
273 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  31.82 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  34.84 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  35.59 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  32.09 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  34.76 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  35.98 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  35.59 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  35.59 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  33.14 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000053  AzlC family protein  31 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.406334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  34.73 
 
 
255 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  32.72 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  34.67 
 
 
286 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  30.56 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  28.12 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  35.03 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  32.76 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  34.7 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2349  AzlC family protein  32.97 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  34.05 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  34.97 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  34.16 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  33.18 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  36.14 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  36.14 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  34.15 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  34.29 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  34.43 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  35.5 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  35.5 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  35.5 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1117  AzlC family protein  33.33 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  35.54 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  32.87 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  30.32 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  30.32 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>