More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0612 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  635    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  71.15 
 
 		 302 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  64.78 
 
 		 320 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  63.84 
 
 		 320 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  44.44 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  44.13 
 
 		 314 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  43.81 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  44.09 
 
 		 321 aa  235  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  44.51 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  42.54 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  44.59 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  45.89 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  42.45 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.95 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  41.82 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  42.77 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  45.19 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  43.09 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  40.32 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  42.72 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  39.68 
 
 		 314 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  42.68 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  42.95 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  37.97 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  38.68 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  35.76 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  38.11 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  38.73 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  37.66 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  35.8 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  35.22 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  35.22 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 352 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  43.55 
 
 		 212 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.01 
 
 		 199 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  39.25 
 
 		 198 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  50.78 
 
 		 132 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  40.21 
 
 		 194 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  45.86 
 
 		 136 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  39.15 
 
 		 194 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  48.84 
 
 		 142 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  48.84 
 
 		 137 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  48.87 
 
 		 137 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  48.89 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 132 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  47.66 
 
 		 132 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  47.66 
 
 		 132 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  47.66 
 
 		 132 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  48.44 
 
 		 128 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  48.84 
 
 		 135 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  46.27 
 
 		 134 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  39.38 
 
 		 196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 		 129 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  49.22 
 
 		 135 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  46.46 
 
 		 138 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  46.46 
 
 		 138 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  42.06 
 
 		 129 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  41.27 
 
 		 130 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  40.48 
 
 		 130 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  42.06 
 
 		 130 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  40.48 
 
 		 130 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  48.46 
 
 		 144 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  44.88 
 
 		 138 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  47.97 
 
 		 133 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  41.27 
 
 		 132 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  41.27 
 
 		 132 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 		 151 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  41.27 
 
 		 132 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  39.2 
 
 		 129 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 133 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  39.68 
 
 		 130 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  37.57 
 
 		 194 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  46.97 
 
 		 138 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  26.48 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  43.94 
 
 		 138 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  35.25 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  38.54 
 
 		 196 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  38.54 
 
 		 196 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 133 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  47.58 
 
 		 150 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  38.54 
 
 		 209 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  38.54 
 
 		 209 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 		 134 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  38.54 
 
 		 209 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  38.54 
 
 		 209 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.8 
 
 		 135 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  38.54 
 
 		 209 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  43.8 
 
 		 139 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  41.27 
 
 		 134 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  37.57 
 
 		 194 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  50.44 
 
 		 146 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  43.8 
 
 		 142 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  44.8 
 
 		 135 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  45.76 
 
 		 137 aa  104  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44 
 
 		 135 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  48.74 
 
 		 136 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  39.67 
 
 		 131 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 		 133 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>