242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0322 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  57.63 
 
 
295 aa  359  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0138  hypothetical protein  51.86 
 
 
293 aa  308  9e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02195  hypothetical protein  45.02 
 
 
281 aa  245  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0741  hypothetical protein  43.73 
 
 
286 aa  244  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2167  hypothetical protein  42.28 
 
 
284 aa  236  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  42.96 
 
 
287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_002950  PG0513  hypothetical protein  40.74 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0201327 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1631  hypothetical protein  37.79 
 
 
292 aa  207  1e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  38.85 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  33.67 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  32.89 
 
 
291 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  32.89 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  32.55 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  32.55 
 
 
291 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  32.55 
 
 
291 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  32.55 
 
 
291 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  32.55 
 
 
291 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  32.55 
 
 
291 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  32.55 
 
 
291 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  32.55 
 
 
291 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  33.22 
 
 
291 aa  159  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  34.46 
 
 
293 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  33.44 
 
 
291 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  33.56 
 
 
292 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  33.22 
 
 
292 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  32.32 
 
 
292 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  33.44 
 
 
295 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  31.54 
 
 
293 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  32.31 
 
 
291 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  32.32 
 
 
292 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  33.12 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  30.41 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  32.56 
 
 
292 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  32.99 
 
 
289 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  32 
 
 
292 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  34.23 
 
 
295 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  30.87 
 
 
292 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  32.89 
 
 
295 aa  143  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  34.35 
 
 
291 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  31.76 
 
 
294 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  31.76 
 
 
294 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  30.17 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  30.13 
 
 
295 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  31.08 
 
 
292 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  29.14 
 
 
293 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  30.74 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  31.65 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  32.32 
 
 
291 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  30.58 
 
 
291 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  32.31 
 
 
292 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  31.79 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  32.11 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  30.91 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  28.62 
 
 
293 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2721  hypothetical protein  32.89 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.151584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  29.19 
 
 
291 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  29.57 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  29.24 
 
 
290 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3194  hypothetical protein  29.49 
 
 
291 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0395546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1999  hypothetical protein  33.44 
 
 
304 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  31.23 
 
 
287 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2086  hypothetical protein  29.68 
 
 
293 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0249545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2276  domain of unknown function DUF1732  33.11 
 
 
304 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173041  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  30.56 
 
 
287 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1469  domain of unknown function DUF1732  31.31 
 
 
287 aa  122  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  28.14 
 
 
293 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  30 
 
 
289 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  29.52 
 
 
326 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  28.52 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  29.24 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  28.72 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  29.24 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  29 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1952  protein of unknown function DUF1732  31.63 
 
 
294 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523153  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  29.93 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  27.95 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0575  hypothetical protein  31.6 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  28.62 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  31.33 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0098  hypothetical protein  30.1 
 
 
294 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1404  hypothetical protein  31.09 
 
 
293 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  27.03 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  31.79 
 
 
291 aa  116  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  27.96 
 
 
287 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  30.74 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  28.47 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0468  hypothetical protein  29.57 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  30.79 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1086  hypothetical protein  30.61 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1140  hypothetical protein  30.65 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  28.15 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2782  domain of unknown function DUF1732  30.41 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  29.73 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  28.62 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0989  YicC domain protein  29.05 
 
 
294 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0120989 
 
 
-
 
NC_004310  BR0463  hypothetical protein  29.24 
 
 
299 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  28.96 
 
 
293 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>