More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  100 
 
 
149 aa  293  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  75.84 
 
 
149 aa  232  1e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  77.18 
 
 
151 aa  218  2e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  65.99 
 
 
150 aa  200  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  64.38 
 
 
150 aa  188  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  59.18 
 
 
148 aa  181  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  62.76 
 
 
151 aa  177  3e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  58.5 
 
 
149 aa  174  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  55.78 
 
 
148 aa  172  1e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  57.14 
 
 
151 aa  171  3e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  57.14 
 
 
148 aa  171  3e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  53.74 
 
 
157 aa  168  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  56.16 
 
 
148 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  56.46 
 
 
148 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  52.38 
 
 
149 aa  165  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  59.86 
 
 
148 aa  165  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  56.08 
 
 
150 aa  164  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  53.1 
 
 
148 aa  164  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  53.1 
 
 
148 aa  162  1e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  55.1 
 
 
148 aa  160  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  55.41 
 
 
150 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  50.34 
 
 
148 aa  151  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  52.41 
 
 
151 aa  148  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  53.69 
 
 
153 aa  144  4e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  47.62 
 
 
148 aa  144  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  50 
 
 
151 aa  140  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  50 
 
 
150 aa  136  9e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  46.36 
 
 
152 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  48.65 
 
 
150 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  47.95 
 
 
148 aa  130  9e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  44.3 
 
 
151 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  48 
 
 
152 aa  127  4e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  48 
 
 
152 aa  127  4e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  48 
 
 
152 aa  127  4e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  43.24 
 
 
148 aa  126  1e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 
148 aa  125  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  46 
 
 
151 aa  124  4e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  44.67 
 
 
151 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  41.78 
 
 
146 aa  115  1e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
148 aa  116  1e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  3.15624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  44 
 
 
152 aa  115  2e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  42.36 
 
 
147 aa  115  2e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.98897e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  39.04 
 
 
150 aa  114  4e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  113  7e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
150 aa  112  2e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
148 aa  112  2e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  110  7e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  42.95 
 
 
147 aa  108  2e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  36.23 
 
 
151 aa  108  2e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
168 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  41.45 
 
 
147 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  34.46 
 
 
170 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0517  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
151 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  38 
 
 
148 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.45753e-06  hitchhiker  1.02152e-13 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  40.14 
 
 
174 aa  104  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 
148 aa  103  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.08464e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  38.62 
 
 
159 aa  103  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
148 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  3.17895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38 
 
 
148 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  34.72 
 
 
149 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 
189 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  36.81 
 
 
149 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 
189 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
151 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.25439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  39.19 
 
 
149 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 
148 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.23092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
147 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
147 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 
209 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  38.89 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  38.81 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_482  ribosomal protein L9  38.57 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  34.03 
 
 
189 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 
204 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  40.82 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  38.78 
 
 
191 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
189 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  38.89 
 
 
178 aa  98.6  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  40.91 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  36.36 
 
 
193 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 
189 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  35.86 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5913  ribosomal protein L9  38.78 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  32.87 
 
 
179 aa  97.4  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  37.5 
 
 
201 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  6.51865e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 
191 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  43.15 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
151 aa  96.7  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.57053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  36 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0064  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.452229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>