207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3642 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  97.54 
 
 		 203 aa  384  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  90.43 
 
 		 202 aa  363  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  92.57 
 
 		 202 aa  357  7e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  92.57 
 
 		 202 aa  357  7e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  92.57 
 
 		 202 aa  357  7e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  92.57 
 
 		 202 aa  357  7e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  84.16 
 
 		 202 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  79.4 
 
 		 203 aa  328  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  80.4 
 
 		 203 aa  322  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  81.5 
 
 		 205 aa  321  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  79.35 
 
 		 204 aa  316  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  79.6 
 
 		 203 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  77.89 
 
 		 203 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  75.37 
 
 		 203 aa  309  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.86 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.7 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.7 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  36.74 
 
 		 250 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.21 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  37.19 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 250 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  39.7 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  35.81 
 
 		 251 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  34.42 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  35.64 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  35.35 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.95 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0796  DSBA oxidoreductase  33.94 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  35.05 
 
 		 249 aa  143  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0818  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.04 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.65 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.65 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.65 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  33.65 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.65 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.65 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.65 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  33.65 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3441  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.79 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.79 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.79 
 
 		 207 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 		 220 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.25 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.25 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.76 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.25 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.25 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.25 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.37 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.37 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2934  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.79 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0782284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.16 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.26 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.21 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  36.32 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  37 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.54 
 
 		 223 aa  107  8.000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.34 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.83 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  36.5 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  31.9 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.29 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  31.34 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.94 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  36.17 
 
 		 275 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  32.6 
 
 		 215 aa  94.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  31.41 
 
 		 293 aa  92.8  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4675  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.46 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 		 210 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  31.51 
 
 		 222 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.62 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  33.01 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>