More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0020 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0021  proline dipeptidase  77.85 
 
 		 440 aa  725    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0022  proline dipeptidase  76.94 
 
 		 439 aa  718    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0020  proline dipeptidase  100 
 
 		 440 aa  910    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0014  proline dipeptidase  78.08 
 
 		 440 aa  726    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.258964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0019  proline dipeptidase  73.35 
 
 		 440 aa  692    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0022  proline dipeptidase  77.45 
 
 		 439 aa  741    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324765  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0017  proline dipeptidase  77.63 
 
 		 440 aa  726    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0016  proline dipeptidase  74.2 
 
 		 440 aa  703    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.98827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0024  proline dipeptidase  79.22 
 
 		 439 aa  744    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.0225878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0022  proline dipeptidase  77.63 
 
 		 440 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0718408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0021  proline dipeptidase  77.63 
 
 		 440 aa  725    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0019  proline dipeptidase  76.94 
 
 		 439 aa  720    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0806227  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0017  proline dipeptidase  76.94 
 
 		 439 aa  721    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.767781  normal  0.0779588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0014  proline dipeptidase  73.74 
 
 		 439 aa  693    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0025  proline dipeptidase  77.17 
 
 		 439 aa  723    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000000409434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0033  proline dipeptidase  73.35 
 
 		 439 aa  692    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.12189  normal  0.0842725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0013  proline dipeptidase  57.24 
 
 		 443 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03734  proline dipeptidase  56.43 
 
 		 448 aa  521  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0199  proline dipeptidase  57.79 
 
 		 443 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4233  proline dipeptidase  52.71 
 
 		 443 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0263  proline dipeptidase  51.36 
 
 		 443 aa  471  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00615185  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4043  proline dipeptidase  52.71 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3900  proline dipeptidase  52.94 
 
 		 443 aa  471  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.022198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3746  proline dipeptidase  51.58 
 
 		 443 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0139114  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0284  proline dipeptidase  51.13 
 
 		 443 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1913  proline dipeptidase  50.9 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137948  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3932  proline dipeptidase  51.13 
 
 		 443 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03738  proline dipeptidase  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4134  peptidase M24  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.689702  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4366  proline dipeptidase  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000311805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4163  proline dipeptidase  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215567  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4310  proline dipeptidase  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.554834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4370  proline dipeptidase  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4263  proline dipeptidase  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4214  proline dipeptidase  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0112386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4228  proline dipeptidase  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000144079  normal  0.0133545 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3948  proline dipeptidase  50.45 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  0.023319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4191  proline dipeptidase  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03687  hypothetical protein  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4070  proline dipeptidase  50 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4317  proline dipeptidase  49.77 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00026447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5286  proline dipeptidase  49.55 
 
 		 443 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0321906  normal  0.0291317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02375  proline dipeptidase  47.48 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3276  proline dipeptidase  46.21 
 
 		 443 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0455  proline dipeptidase  41.06 
 
 		 429 aa  299  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3908  proline dipeptidase  38.53 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5810  peptidase M24  37.94 
 
 		 470 aa  269  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.924426 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  31.58 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  33.78 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  32.63 
 
 		 475 aa  139  7.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  26.62 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  28.87 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  27.61 
 
 		 439 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  28.6 
 
 		 454 aa  133  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  33.1 
 
 		 463 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  31.6 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0500  putative aminopeptidase P  31.54 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0229386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  32.08 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  30.72 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_29983  predicted protein  31.06 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  28.86 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0766  peptidase M24  32.31 
 
 		 459 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.498025  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  28.71 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02200  prolidase, putative  27.54 
 
 		 546 aa  127  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.555786  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  32.09 
 
 		 451 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  28.27 
 
 		 458 aa  126  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  28.34 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  31.86 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  35.02 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  35.47 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1467  Xaa-Pro dipeptidase  31.49 
 
 		 493 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  27.46 
 
 		 437 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  34.8 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  26.43 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  26.43 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  29.94 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  30.02 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  27.13 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  27.59 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  30.7 
 
 		 461 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  27.83 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  34.25 
 
 		 499 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  29.82 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  30.32 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  27.21 
 
 		 473 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  31.47 
 
 		 441 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  33.33 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  28.22 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  29.57 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  29.13 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  30.85 
 
 		 465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  26.93 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  28.18 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  31.69 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  27.75 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  34.48 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  27.17 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  27.17 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  27.19 
 
 		 462 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  31.01 
 
 		 439 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>