86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16010 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16010  predicted aminopeptidase  100 
 
 
335 aa  696    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  hitchhiker  0.000000285922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  27.38 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  25.29 
 
 
647 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  25.36 
 
 
647 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  25.45 
 
 
1247 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  24.65 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  28.7 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  32.14 
 
 
502 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  36.45 
 
 
463 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  31.79 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  30.77 
 
 
947 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  33.33 
 
 
512 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  36.63 
 
 
391 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  37.76 
 
 
488 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  33.33 
 
 
319 aa  53.9  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  27.27 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3246  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  21.59 
 
 
348 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  35.71 
 
 
488 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3061  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  21.59 
 
 
348 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  30.63 
 
 
512 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3126  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  21.59 
 
 
348 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3142  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  21.59 
 
 
348 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.634375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3087  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  21.59 
 
 
348 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  34.43 
 
 
515 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  27.16 
 
 
512 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  30.28 
 
 
548 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35493  predicted protein  27.54 
 
 
450 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0224729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  32.29 
 
 
513 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.3 
 
 
318 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  29.46 
 
 
514 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  29.93 
 
 
512 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  26.23 
 
 
347 aa  49.7  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  26.55 
 
 
333 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  30.77 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  29.13 
 
 
518 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  31.2 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  30.91 
 
 
503 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  30.34 
 
 
775 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  32.04 
 
 
535 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0935  peptidase M28  21.87 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  32.04 
 
 
536 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  28.11 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  28.8 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  34.38 
 
 
501 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  28.11 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  28.11 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  34.38 
 
 
501 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0019  hypothetical protein  27.85 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  34.38 
 
 
501 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  25.81 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  28.65 
 
 
384 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2879  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  21.62 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02603  aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion  21.62 
 
 
345 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4005  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  21.62 
 
 
345 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02568  hypothetical protein  21.62 
 
 
345 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0959  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  21.62 
 
 
345 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3054  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  21.62 
 
 
345 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.957011  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  28.26 
 
 
408 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  28.26 
 
 
408 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  27.72 
 
 
408 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  28.57 
 
 
282 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3121  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  21.62 
 
 
345 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2891  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  21.62 
 
 
345 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  40.68 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  31.37 
 
 
534 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  25.57 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  35.79 
 
 
1103 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  24.2 
 
 
1131 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  28.4 
 
 
479 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  32.91 
 
 
476 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  32.95 
 
 
525 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  28.4 
 
 
479 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  30.09 
 
 
509 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  28.4 
 
 
479 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  30.21 
 
 
510 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  31.62 
 
 
734 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  36 
 
 
794 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  29.17 
 
 
394 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4970  aminopeptidase-like protein  36.36 
 
 
442 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  32.26 
 
 
438 aa  43.5  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  29.73 
 
 
555 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.67 
 
 
529 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  27.93 
 
 
524 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  33.64 
 
 
512 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  43.33 
 
 
299 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  32.58 
 
 
472 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>