84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0289 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  98.85 
 
 		 349 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  99.14 
 
 		 349 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  98.28 
 
 		 347 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  100 
 
 		 351 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  45.2 
 
 		 365 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  45.14 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  44.13 
 
 		 361 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  41.67 
 
 		 361 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  44 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  43.18 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  43.39 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  42.86 
 
 		 367 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  42.74 
 
 		 372 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  43.34 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  43.06 
 
 		 356 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  42.86 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  43.02 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  42.7 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  40.34 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  51.79 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  51.79 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  51.79 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  51.79 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  51.79 
 
 		 367 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  51.79 
 
 		 371 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 397 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 397 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  33.42 
 
 		 393 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  30.5 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.36 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.75 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  33.43 
 
 		 371 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  31.94 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  26.63 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.33 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.88 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  30.31 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  29.63 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  28.86 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  30 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.61 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  33.51 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  37.78 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  31.88 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  33.33 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  33.33 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  33.33 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  26.69 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  28.25 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  27.64 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  24.85 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  24.47 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  23.54 
 
 		 376 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3437  ImpA domain-containing protein  22.16 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00156719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  22.16 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  22.16 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  24.5 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  24.5 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  25 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  29.08 
 
 		 357 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  29.08 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  25 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  25 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  28.24 
 
 		 522 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.71 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  23.85 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  23.99 
 
 		 312 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  23.99 
 
 		 312 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  27.96 
 
 		 314 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  25.86 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  25.86 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  22.66 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  23.99 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  25.86 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  25.86 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  30.89 
 
 		 789 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  31.07 
 
 		 530 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>